Protein–RNA interactions for Protein: P19022

CDH2, Cadherin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH2P19022 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH2P19022 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH2P19022 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH2P19022 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH2P19022 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH2P19022 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH2P19022 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH2P19022 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH2P19022 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH2P19022 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH2P19022 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH2P19022 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH2P19022 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH2P19022 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH2P19022 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH2P19022 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH2P19022 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH2P19022 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH2P19022 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH2P19022 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH2P19022 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH2P19022 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH2P19022 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH2P19022 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH2P19022 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDH2P19022 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH2P19022 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH2P19022 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH2P19022 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH2P19022 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH2P19022 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH2P19022 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH2P19022 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH2P19022 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH2P19022 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH2P19022 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH2P19022 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH2P19022 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH2P19022 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH2P19022 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH2P19022 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDH2P19022 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDH2P19022 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH2P19022 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH2P19022 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH2P19022 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH2P19022 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH2P19022 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH2P19022 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH2P19022 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH2P19022 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH2P19022 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH2P19022 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH2P19022 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH2P19022 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH2P19022 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH2P19022 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH2P19022 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH2P19022 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH2P19022 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH2P19022 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDH2P19022 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDH2P19022 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDH2P19022 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH2P19022 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH2P19022 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH2P19022 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH2P19022 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH2P19022 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH2P19022 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH2P19022 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH2P19022 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH2P19022 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH2P19022 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH2P19022 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH2P19022 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH2P19022 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH2P19022 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH2P19022 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH2P19022 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH2P19022 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH2P19022 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH2P19022 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH2P19022 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH2P19022 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH2P19022 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH2P19022 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH2P19022 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH2P19022 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH2P19022 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH2P19022 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH2P19022 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH2P19022 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH2P19022 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH2P19022 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH2P19022 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH2P19022 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDH2P19022 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDH2P19022 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDH2P19022 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms