Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
KRT15P19012 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
KRT15P19012 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT15P19012 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT15P19012 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT15P19012 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT15P19012 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT15P19012 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT15P19012 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT15P19012 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT15P19012 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT15P19012 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT15P19012 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT15P19012 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT15P19012 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT15P19012 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT15P19012 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT15P19012 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT15P19012 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT15P19012 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT15P19012 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT15P19012 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT15P19012 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT15P19012 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT15P19012 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT15P19012 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT15P19012 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT15P19012 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT15P19012 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT15P19012 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT15P19012 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT15P19012 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT15P19012 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT15P19012 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT15P19012 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT15P19012 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT15P19012 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT15P19012 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT15P19012 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT15P19012 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT15P19012 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT15P19012 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT15P19012 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT15P19012 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT15P19012 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT15P19012 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT15P19012 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT15P19012 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT15P19012 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT15P19012 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT15P19012 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT15P19012 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT15P19012 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT15P19012 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT15P19012 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT15P19012 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT15P19012 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT15P19012 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT15P19012 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT15P19012 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT15P19012 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT15P19012 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT15P19012 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT15P19012 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT15P19012 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT15P19012 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT15P19012 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT15P19012 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT15P19012 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT15P19012 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT15P19012 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT15P19012 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT15P19012 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT15P19012 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT15P19012 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT15P19012 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT15P19012 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT15P19012 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT15P19012 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT15P19012 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT15P19012 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT15P19012 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT15P19012 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT15P19012 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT15P19012 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT15P19012 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT15P19012 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT15P19012 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT15P19012 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT15P19012 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT15P19012 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT15P19012 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT15P19012 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT15P19012 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT15P19012 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT15P19012 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT15P19012 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT15P19012 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT15P19012 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT15P19012 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms