Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RargP18911 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RargP18911 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RargP18911 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RargP18911 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RargP18911 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RargP18911 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RargP18911 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RargP18911 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RargP18911 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RargP18911 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RargP18911 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RargP18911 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RargP18911 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RargP18911 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RargP18911 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RargP18911 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RargP18911 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RargP18911 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RargP18911 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RargP18911 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RargP18911 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RargP18911 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RargP18911 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RargP18911 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RargP18911 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RargP18911 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RargP18911 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RargP18911 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RargP18911 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RargP18911 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RargP18911 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RargP18911 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RargP18911 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RargP18911 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RargP18911 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RargP18911 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RargP18911 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RargP18911 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RargP18911 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RargP18911 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RargP18911 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RargP18911 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RargP18911 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RargP18911 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RargP18911 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RargP18911 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RargP18911 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RargP18911 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RargP18911 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RargP18911 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RargP18911 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RargP18911 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RargP18911 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RargP18911 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RargP18911 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RargP18911 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RargP18911 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RargP18911 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RargP18911 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RargP18911 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RargP18911 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RargP18911 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RargP18911 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RargP18911 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RargP18911 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RargP18911 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RargP18911 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RargP18911 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RargP18911 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RargP18911 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RargP18911 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RargP18911 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RargP18911 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RargP18911 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RargP18911 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RargP18911 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RargP18911 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RargP18911 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RargP18911 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RargP18911 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RargP18911 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RargP18911 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RargP18911 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RargP18911 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RargP18911 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RargP18911 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RargP18911 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RargP18911 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RargP18911 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RargP18911 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RargP18911 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RargP18911 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RargP18911 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RargP18911 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RargP18911 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RargP18911 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RargP18911 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RargP18911 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RargP18911 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms