Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps6ka3P18654 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps6ka3P18654 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps6ka3P18654 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps6ka3P18654 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps6ka3P18654 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6ka3P18654 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6ka3P18654 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6ka3P18654 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rps6ka3P18654 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rps6ka3P18654 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rps6ka3P18654 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rps6ka3P18654 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rps6ka3P18654 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6ka3P18654 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6ka3P18654 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6ka3P18654 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps6ka3P18654 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps6ka3P18654 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps6ka3P18654 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps6ka3P18654 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps6ka3P18654 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps6ka3P18654 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps6ka3P18654 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps6ka3P18654 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps6ka3P18654 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps6ka3P18654 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps6ka3P18654 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps6ka3P18654 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps6ka3P18654 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps6ka3P18654 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps6ka3P18654 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6ka3P18654 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6ka3P18654 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6ka3P18654 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6ka3P18654 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6ka3P18654 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps6ka3P18654 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps6ka3P18654 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps6ka3P18654 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps6ka3P18654 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6ka3P18654 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6ka3P18654 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6ka3P18654 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6ka3P18654 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps6ka3P18654 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps6ka3P18654 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rps6ka3P18654 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6ka3P18654 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6ka3P18654 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6ka3P18654 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps6ka3P18654 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps6ka3P18654 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps6ka3P18654 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps6ka3P18654 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps6ka3P18654 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6ka3P18654 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6ka3P18654 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6ka3P18654 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6ka3P18654 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6ka3P18654 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6ka3P18654 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6ka3P18654 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6ka3P18654 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6ka3P18654 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6ka3P18654 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6ka3P18654 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6ka3P18654 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6ka3P18654 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rps6ka3P18654 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rps6ka3P18654 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rps6ka3P18654 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rps6ka3P18654 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rps6ka3P18654 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rps6ka3P18654 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rps6ka3P18654 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rps6ka3P18654 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rps6ka3P18654 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rps6ka3P18654 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rps6ka3P18654 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rps6ka3P18654 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rps6ka3P18654 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rps6ka3P18654 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rps6ka3P18654 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rps6ka3P18654 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rps6ka3P18654 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rps6ka3P18654 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rps6ka3P18654 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rps6ka3P18654 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rps6ka3P18654 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rps6ka3P18654 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rps6ka3P18654 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rps6ka3P18654 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rps6ka3P18654 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rps6ka3P18654 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rps6ka3P18654 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rps6ka3P18654 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rps6ka3P18654 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rps6ka3P18654 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rps6ka3P18654 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms