Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCP1P17987 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCP1P17987 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCP1P17987 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCP1P17987 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCP1P17987 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCP1P17987 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCP1P17987 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCP1P17987 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCP1P17987 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCP1P17987 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TCP1P17987 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TCP1P17987 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TCP1P17987 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TCP1P17987 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TCP1P17987 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TCP1P17987 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCP1P17987 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCP1P17987 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCP1P17987 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCP1P17987 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCP1P17987 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCP1P17987 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCP1P17987 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCP1P17987 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCP1P17987 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCP1P17987 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCP1P17987 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TCP1P17987 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCP1P17987 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCP1P17987 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCP1P17987 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCP1P17987 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCP1P17987 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCP1P17987 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TCP1P17987 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TCP1P17987 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TCP1P17987 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCP1P17987 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCP1P17987 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TCP1P17987 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TCP1P17987 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TCP1P17987 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCP1P17987 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCP1P17987 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCP1P17987 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCP1P17987 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TCP1P17987 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TCP1P17987 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TCP1P17987 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TCP1P17987 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TCP1P17987 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCP1P17987 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCP1P17987 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCP1P17987 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCP1P17987 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCP1P17987 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TCP1P17987 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TCP1P17987 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TCP1P17987 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TCP1P17987 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TCP1P17987 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TCP1P17987 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCP1P17987 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCP1P17987 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TCP1P17987 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TCP1P17987 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TCP1P17987 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TCP1P17987 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TCP1P17987 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TCP1P17987 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TCP1P17987 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TCP1P17987 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TCP1P17987 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TCP1P17987 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TCP1P17987 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TCP1P17987 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TCP1P17987 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TCP1P17987 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TCP1P17987 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TCP1P17987 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TCP1P17987 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TCP1P17987 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TCP1P17987 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TCP1P17987 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TCP1P17987 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TCP1P17987 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TCP1P17987 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TCP1P17987 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TCP1P17987 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TCP1P17987 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TCP1P17987 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TCP1P17987 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TCP1P17987 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCP1P17987 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCP1P17987 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TCP1P17987 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TCP1P17987 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TCP1P17987 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TCP1P17987 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms