Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxb1P17919 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxb1P17919 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxb1P17919 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxb1P17919 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxb1P17919 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxb1P17919 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxb1P17919 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxb1P17919 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxb1P17919 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxb1P17919 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxb1P17919 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxb1P17919 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxb1P17919 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxb1P17919 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxb1P17919 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxb1P17919 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxb1P17919 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxb1P17919 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxb1P17919 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxb1P17919 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxb1P17919 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxb1P17919 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxb1P17919 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxb1P17919 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxb1P17919 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxb1P17919 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxb1P17919 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxb1P17919 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxb1P17919 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxb1P17919 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxb1P17919 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxb1P17919 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxb1P17919 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxb1P17919 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxb1P17919 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxb1P17919 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxb1P17919 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxb1P17919 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxb1P17919 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxb1P17919 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxb1P17919 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxb1P17919 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxb1P17919 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxb1P17919 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxb1P17919 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxb1P17919 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxb1P17919 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxb1P17919 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxb1P17919 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxb1P17919 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxb1P17919 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxb1P17919 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxb1P17919 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxb1P17919 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxb1P17919 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxb1P17919 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxb1P17919 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxb1P17919 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxb1P17919 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxb1P17919 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxb1P17919 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxb1P17919 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxb1P17919 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxb1P17919 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxb1P17919 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxb1P17919 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxb1P17919 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxb1P17919 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxb1P17919 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxb1P17919 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxb1P17919 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxb1P17919 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxb1P17919 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxb1P17919 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxb1P17919 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxb1P17919 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxb1P17919 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxb1P17919 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxb1P17919 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxb1P17919 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxb1P17919 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hoxb1P17919 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hoxb1P17919 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxb1P17919 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxb1P17919 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxb1P17919 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxb1P17919 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxb1P17919 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxb1P17919 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxb1P17919 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxb1P17919 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxb1P17919 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxb1P17919 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxb1P17919 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxb1P17919 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxb1P17919 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxb1P17919 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxb1P17919 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxb1P17919 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms