Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
XBP1P17861 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
XBP1P17861 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
XBP1P17861 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
XBP1P17861 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
XBP1P17861 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
XBP1P17861 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
XBP1P17861 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
XBP1P17861 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
XBP1P17861 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
XBP1P17861 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
XBP1P17861 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
XBP1P17861 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
XBP1P17861 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
XBP1P17861 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
XBP1P17861 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
XBP1P17861 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
XBP1P17861 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
XBP1P17861 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
XBP1P17861 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
XBP1P17861 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
XBP1P17861 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
XBP1P17861 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
XBP1P17861 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
XBP1P17861 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
XBP1P17861 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
XBP1P17861 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
XBP1P17861 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
XBP1P17861 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
XBP1P17861 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
XBP1P17861 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
XBP1P17861 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
XBP1P17861 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
XBP1P17861 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
XBP1P17861 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
XBP1P17861 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
XBP1P17861 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
XBP1P17861 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
XBP1P17861 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
XBP1P17861 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
XBP1P17861 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
XBP1P17861 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
XBP1P17861 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
XBP1P17861 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
XBP1P17861 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
XBP1P17861 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
XBP1P17861 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
XBP1P17861 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
XBP1P17861 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
XBP1P17861 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
XBP1P17861 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
XBP1P17861 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
XBP1P17861 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
XBP1P17861 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
XBP1P17861 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
XBP1P17861 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
XBP1P17861 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
XBP1P17861 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
XBP1P17861 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
XBP1P17861 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
XBP1P17861 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
XBP1P17861 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
XBP1P17861 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
XBP1P17861 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
XBP1P17861 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
XBP1P17861 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
XBP1P17861 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
XBP1P17861 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
XBP1P17861 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
XBP1P17861 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
XBP1P17861 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
XBP1P17861 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
XBP1P17861 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
XBP1P17861 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
XBP1P17861 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
XBP1P17861 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
XBP1P17861 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
XBP1P17861 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
XBP1P17861 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
XBP1P17861 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
XBP1P17861 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
XBP1P17861 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
XBP1P17861 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
XBP1P17861 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
XBP1P17861 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
XBP1P17861 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
XBP1P17861 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
XBP1P17861 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
XBP1P17861 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
XBP1P17861 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
XBP1P17861 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
XBP1P17861 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
XBP1P17861 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
XBP1P17861 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
XBP1P17861 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
XBP1P17861 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
XBP1P17861 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
XBP1P17861 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
XBP1P17861 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
XBP1P17861 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms