Protein–RNA interactions for Protein: P17706

PTPN2, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN2P17706 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPN2P17706 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPN2P17706 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPN2P17706 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPN2P17706 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPN2P17706 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPN2P17706 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPN2P17706 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPN2P17706 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPN2P17706 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPN2P17706 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPN2P17706 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPN2P17706 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPN2P17706 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPN2P17706 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPN2P17706 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPN2P17706 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPN2P17706 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPN2P17706 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPN2P17706 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPN2P17706 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPN2P17706 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPN2P17706 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPN2P17706 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPN2P17706 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPN2P17706 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPN2P17706 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPN2P17706 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPN2P17706 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPN2P17706 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPN2P17706 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPN2P17706 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTPN2P17706 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTPN2P17706 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPN2P17706 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPN2P17706 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPN2P17706 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPN2P17706 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPN2P17706 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPN2P17706 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPN2P17706 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPN2P17706 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPN2P17706 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPN2P17706 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPN2P17706 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPN2P17706 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPN2P17706 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPN2P17706 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPN2P17706 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPN2P17706 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPN2P17706 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPN2P17706 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPN2P17706 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPN2P17706 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPN2P17706 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPN2P17706 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPN2P17706 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPN2P17706 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPN2P17706 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPN2P17706 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPN2P17706 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPN2P17706 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPN2P17706 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPN2P17706 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPN2P17706 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPN2P17706 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPN2P17706 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPN2P17706 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPN2P17706 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPN2P17706 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPN2P17706 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPN2P17706 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PTPN2P17706 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PTPN2P17706 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN2P17706 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN2P17706 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN2P17706 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN2P17706 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPN2P17706 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPN2P17706 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPN2P17706 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPN2P17706 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPN2P17706 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPN2P17706 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPN2P17706 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN2P17706 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN2P17706 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN2P17706 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN2P17706 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN2P17706 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN2P17706 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPN2P17706 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPN2P17706 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPN2P17706 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPN2P17706 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPN2P17706 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPN2P17706 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPN2P17706 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPN2P17706 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPN2P17706 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184 ms