Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXB4P17483 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXB4P17483 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXB4P17483 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXB4P17483 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXB4P17483 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXB4P17483 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXB4P17483 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXB4P17483 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXB4P17483 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXB4P17483 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXB4P17483 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXB4P17483 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXB4P17483 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXB4P17483 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXB4P17483 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB4P17483 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB4P17483 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB4P17483 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB4P17483 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXB4P17483 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXB4P17483 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXB4P17483 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXB4P17483 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXB4P17483 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXB4P17483 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB4P17483 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB4P17483 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB4P17483 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB4P17483 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB4P17483 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB4P17483 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB4P17483 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXB4P17483 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB4P17483 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB4P17483 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB4P17483 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB4P17483 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB4P17483 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB4P17483 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB4P17483 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB4P17483 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB4P17483 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB4P17483 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB4P17483 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB4P17483 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB4P17483 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB4P17483 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB4P17483 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB4P17483 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB4P17483 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB4P17483 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB4P17483 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB4P17483 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB4P17483 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXB4P17483 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB4P17483 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB4P17483 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB4P17483 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB4P17483 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB4P17483 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXB4P17483 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXB4P17483 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXB4P17483 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB4P17483 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXB4P17483 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXB4P17483 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXB4P17483 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB4P17483 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB4P17483 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXB4P17483 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXB4P17483 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXB4P17483 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXB4P17483 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXB4P17483 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXB4P17483 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB4P17483 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB4P17483 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB4P17483 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB4P17483 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB4P17483 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB4P17483 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB4P17483 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB4P17483 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB4P17483 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB4P17483 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB4P17483 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB4P17483 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB4P17483 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB4P17483 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXB4P17483 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXB4P17483 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXB4P17483 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXB4P17483 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXB4P17483 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXB4P17483 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXB4P17483 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB4P17483 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB4P17483 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB4P17483 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms