Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXB9P17482 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXB9P17482 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXB9P17482 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXB9P17482 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXB9P17482 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXB9P17482 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXB9P17482 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXB9P17482 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXB9P17482 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXB9P17482 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXB9P17482 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXB9P17482 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXB9P17482 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXB9P17482 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXB9P17482 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXB9P17482 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXB9P17482 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXB9P17482 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB9P17482 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB9P17482 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB9P17482 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB9P17482 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB9P17482 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB9P17482 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB9P17482 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB9P17482 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXB9P17482 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXB9P17482 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXB9P17482 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXB9P17482 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXB9P17482 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXB9P17482 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB9P17482 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB9P17482 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB9P17482 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB9P17482 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB9P17482 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXB9P17482 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXB9P17482 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXB9P17482 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXB9P17482 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXB9P17482 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB9P17482 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB9P17482 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB9P17482 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB9P17482 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXB9P17482 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXB9P17482 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXB9P17482 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXB9P17482 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXB9P17482 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXB9P17482 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXB9P17482 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HOXB9P17482 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HOXB9P17482 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXB9P17482 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXB9P17482 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXB9P17482 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXB9P17482 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB9P17482 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB9P17482 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB9P17482 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB9P17482 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB9P17482 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB9P17482 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB9P17482 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXB9P17482 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXB9P17482 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXB9P17482 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXB9P17482 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB9P17482 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB9P17482 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB9P17482 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB9P17482 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB9P17482 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB9P17482 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB9P17482 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB9P17482 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB9P17482 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB9P17482 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXB9P17482 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXB9P17482 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXB9P17482 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXB9P17482 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXB9P17482 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXB9P17482 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXB9P17482 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXB9P17482 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXB9P17482 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXB9P17482 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXB9P17482 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXB9P17482 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXB9P17482 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXB9P17482 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXB9P17482 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXB9P17482 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXB9P17482 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXB9P17482 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXB9P17482 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 318.9 ms