Protein–RNA interactions for Protein: P16870

CPE, Carboxypeptidase E, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEP16870 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPEP16870 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPEP16870 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPEP16870 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPEP16870 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CPEP16870 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPEP16870 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPEP16870 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPEP16870 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPEP16870 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPEP16870 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPEP16870 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPEP16870 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPEP16870 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPEP16870 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPEP16870 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPEP16870 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPEP16870 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPEP16870 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPEP16870 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPEP16870 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPEP16870 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPEP16870 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPEP16870 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPEP16870 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPEP16870 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPEP16870 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPEP16870 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPEP16870 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPEP16870 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPEP16870 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPEP16870 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPEP16870 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPEP16870 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPEP16870 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPEP16870 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPEP16870 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPEP16870 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPEP16870 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPEP16870 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPEP16870 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPEP16870 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPEP16870 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPEP16870 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPEP16870 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPEP16870 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CPEP16870 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPEP16870 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPEP16870 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPEP16870 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPEP16870 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPEP16870 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPEP16870 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPEP16870 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CPEP16870 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPEP16870 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPEP16870 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPEP16870 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPEP16870 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPEP16870 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPEP16870 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPEP16870 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPEP16870 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPEP16870 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPEP16870 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPEP16870 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPEP16870 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPEP16870 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPEP16870 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPEP16870 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPEP16870 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPEP16870 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPEP16870 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPEP16870 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPEP16870 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPEP16870 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPEP16870 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPEP16870 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPEP16870 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPEP16870 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CPEP16870 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPEP16870 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPEP16870 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPEP16870 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPEP16870 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPEP16870 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPEP16870 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPEP16870 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CPEP16870 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPEP16870 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPEP16870 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPEP16870 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPEP16870 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPEP16870 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CPEP16870 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CPEP16870 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPEP16870 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPEP16870 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPEP16870 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPEP16870 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms