Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GNB3P16520 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GNB3P16520 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GNB3P16520 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GNB3P16520 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GNB3P16520 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GNB3P16520 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GNB3P16520 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GNB3P16520 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GNB3P16520 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GNB3P16520 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GNB3P16520 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GNB3P16520 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GNB3P16520 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GNB3P16520 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GNB3P16520 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GNB3P16520 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GNB3P16520 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GNB3P16520 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GNB3P16520 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GNB3P16520 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GNB3P16520 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GNB3P16520 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GNB3P16520 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GNB3P16520 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GNB3P16520 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GNB3P16520 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GNB3P16520 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GNB3P16520 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GNB3P16520 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GNB3P16520 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GNB3P16520 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GNB3P16520 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GNB3P16520 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GNB3P16520 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GNB3P16520 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GNB3P16520 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GNB3P16520 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GNB3P16520 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GNB3P16520 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GNB3P16520 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GNB3P16520 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GNB3P16520 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GNB3P16520 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GNB3P16520 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GNB3P16520 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GNB3P16520 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GNB3P16520 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GNB3P16520 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GNB3P16520 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GNB3P16520 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GNB3P16520 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GNB3P16520 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GNB3P16520 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
GNB3P16520 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GNB3P16520 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GNB3P16520 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GNB3P16520 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GNB3P16520 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GNB3P16520 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GNB3P16520 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GNB3P16520 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GNB3P16520 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GNB3P16520 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GNB3P16520 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GNB3P16520 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GNB3P16520 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GNB3P16520 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GNB3P16520 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GNB3P16520 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GNB3P16520 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GNB3P16520 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GNB3P16520 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GNB3P16520 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GNB3P16520 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GNB3P16520 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GNB3P16520 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GNB3P16520 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GNB3P16520 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GNB3P16520 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GNB3P16520 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GNB3P16520 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GNB3P16520 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GNB3P16520 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GNB3P16520 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GNB3P16520 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GNB3P16520 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GNB3P16520 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GNB3P16520 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GNB3P16520 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GNB3P16520 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GNB3P16520 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GNB3P16520 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GNB3P16520 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GNB3P16520 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GNB3P16520 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GNB3P16520 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GNB3P16520 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GNB3P16520 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GNB3P16520 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms