Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ass1P16460 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ass1P16460 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ass1P16460 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ass1P16460 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ass1P16460 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ass1P16460 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ass1P16460 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ass1P16460 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ass1P16460 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ass1P16460 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ass1P16460 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ass1P16460 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ass1P16460 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ass1P16460 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ass1P16460 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ass1P16460 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ass1P16460 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ass1P16460 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ass1P16460 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ass1P16460 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ass1P16460 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ass1P16460 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ass1P16460 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ass1P16460 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ass1P16460 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ass1P16460 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ass1P16460 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ass1P16460 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ass1P16460 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ass1P16460 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ass1P16460 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ass1P16460 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ass1P16460 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ass1P16460 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ass1P16460 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ass1P16460 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ass1P16460 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ass1P16460 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ass1P16460 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ass1P16460 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ass1P16460 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ass1P16460 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ass1P16460 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ass1P16460 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ass1P16460 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ass1P16460 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ass1P16460 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ass1P16460 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ass1P16460 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ass1P16460 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ass1P16460 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ass1P16460 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ass1P16460 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ass1P16460 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ass1P16460 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ass1P16460 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ass1P16460 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ass1P16460 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ass1P16460 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ass1P16460 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ass1P16460 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ass1P16460 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ass1P16460 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ass1P16460 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ass1P16460 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ass1P16460 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ass1P16460 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ass1P16460 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ass1P16460 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ass1P16460 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ass1P16460 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ass1P16460 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ass1P16460 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ass1P16460 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ass1P16460 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ass1P16460 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ass1P16460 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ass1P16460 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ass1P16460 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ass1P16460 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ass1P16460 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ass1P16460 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ass1P16460 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ass1P16460 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ass1P16460 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ass1P16460 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ass1P16460 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ass1P16460 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ass1P16460 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ass1P16460 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ass1P16460 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ass1P16460 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ass1P16460 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ass1P16460 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ass1P16460 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ass1P16460 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ass1P16460 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ass1P16460 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ass1P16460 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms