Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPB42P16452 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPB42P16452 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPB42P16452 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EPB42P16452 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPB42P16452 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPB42P16452 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EPB42P16452 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EPB42P16452 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPB42P16452 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPB42P16452 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPB42P16452 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPB42P16452 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPB42P16452 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPB42P16452 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EPB42P16452 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EPB42P16452 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EPB42P16452 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPB42P16452 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPB42P16452 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPB42P16452 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPB42P16452 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPB42P16452 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPB42P16452 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPB42P16452 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPB42P16452 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPB42P16452 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
EPB42P16452 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPB42P16452 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPB42P16452 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPB42P16452 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPB42P16452 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPB42P16452 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPB42P16452 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPB42P16452 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
EPB42P16452 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPB42P16452 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPB42P16452 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPB42P16452 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
EPB42P16452 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EPB42P16452 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EPB42P16452 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EPB42P16452 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EPB42P16452 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EPB42P16452 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
EPB42P16452 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPB42P16452 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPB42P16452 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPB42P16452 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
EPB42P16452 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPB42P16452 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPB42P16452 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPB42P16452 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPB42P16452 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPB42P16452 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPB42P16452 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPB42P16452 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPB42P16452 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPB42P16452 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPB42P16452 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPB42P16452 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPB42P16452 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPB42P16452 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPB42P16452 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPB42P16452 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPB42P16452 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPB42P16452 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPB42P16452 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPB42P16452 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EPB42P16452 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPB42P16452 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EPB42P16452 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPB42P16452 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPB42P16452 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPB42P16452 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPB42P16452 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPB42P16452 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPB42P16452 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPB42P16452 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPB42P16452 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPB42P16452 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EPB42P16452 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPB42P16452 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPB42P16452 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPB42P16452 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPB42P16452 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPB42P16452 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
EPB42P16452 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPB42P16452 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPB42P16452 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPB42P16452 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPB42P16452 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
EPB42P16452 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPB42P16452 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPB42P16452 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPB42P16452 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EPB42P16452 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
EPB42P16452 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPB42P16452 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPB42P16452 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.1 ms