Protein–RNA interactions for Protein: P16390

Kcna3, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna3P16390 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Kcna3P16390 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Kcna3P16390 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Kcna3P16390 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Kcna3P16390 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Kcna3P16390 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Kcna3P16390 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Kcna3P16390 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Kcna3P16390 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Kcna3P16390 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Kcna3P16390 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Kcna3P16390 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Kcna3P16390 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Kcna3P16390 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Kcna3P16390 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Kcna3P16390 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Kcna3P16390 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Kcna3P16390 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Kcna3P16390 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Kcna3P16390 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Kcna3P16390 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Kcna3P16390 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Kcna3P16390 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Kcna3P16390 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Kcna3P16390 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Kcna3P16390 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Kcna3P16390 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Kcna3P16390 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Kcna3P16390 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Kcna3P16390 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Kcna3P16390 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Kcna3P16390 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Kcna3P16390 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Kcna3P16390 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Kcna3P16390 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Kcna3P16390 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Kcna3P16390 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Kcna3P16390 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Kcna3P16390 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Kcna3P16390 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Kcna3P16390 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Kcna3P16390 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Kcna3P16390 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Kcna3P16390 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Kcna3P16390 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Kcna3P16390 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Kcna3P16390 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Kcna3P16390 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Kcna3P16390 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Kcna3P16390 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Kcna3P16390 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Kcna3P16390 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Kcna3P16390 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Kcna3P16390 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Kcna3P16390 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Kcna3P16390 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Kcna3P16390 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Kcna3P16390 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Kcna3P16390 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Kcna3P16390 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Kcna3P16390 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Kcna3P16390 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Kcna3P16390 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Kcna3P16390 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Kcna3P16390 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Kcna3P16390 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Kcna3P16390 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Kcna3P16390 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Kcna3P16390 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Kcna3P16390 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Kcna3P16390 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Kcna3P16390 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Kcna3P16390 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Kcna3P16390 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Kcna3P16390 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Kcna3P16390 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Kcna3P16390 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Kcna3P16390 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Kcna3P16390 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Kcna3P16390 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Kcna3P16390 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Kcna3P16390 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Kcna3P16390 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Kcna3P16390 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Kcna3P16390 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Kcna3P16390 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Kcna3P16390 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Kcna3P16390 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Kcna3P16390 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Kcna3P16390 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Kcna3P16390 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Kcna3P16390 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Kcna3P16390 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Kcna3P16390 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Kcna3P16390 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Kcna3P16390 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Kcna3P16390 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Kcna3P16390 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Kcna3P16390 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Kcna3P16390 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms