Protein–RNA interactions for Protein: P16112

ACAN, Aggrecan core protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACANP16112 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ACANP16112 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACANP16112 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACANP16112 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACANP16112 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACANP16112 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACANP16112 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACANP16112 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACANP16112 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACANP16112 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACANP16112 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACANP16112 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACANP16112 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACANP16112 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACANP16112 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACANP16112 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACANP16112 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACANP16112 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ACANP16112 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACANP16112 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACANP16112 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ACANP16112 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACANP16112 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACANP16112 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACANP16112 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACANP16112 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACANP16112 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACANP16112 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACANP16112 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ACANP16112 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACANP16112 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACANP16112 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACANP16112 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACANP16112 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACANP16112 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACANP16112 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACANP16112 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACANP16112 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACANP16112 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACANP16112 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACANP16112 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACANP16112 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ACANP16112 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACANP16112 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACANP16112 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACANP16112 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACANP16112 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACANP16112 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACANP16112 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACANP16112 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACANP16112 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACANP16112 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACANP16112 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACANP16112 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACANP16112 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACANP16112 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACANP16112 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACANP16112 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACANP16112 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACANP16112 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACANP16112 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACANP16112 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACANP16112 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACANP16112 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACANP16112 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACANP16112 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACANP16112 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACANP16112 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACANP16112 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ACANP16112 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACANP16112 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACANP16112 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACANP16112 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACANP16112 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACANP16112 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACANP16112 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACANP16112 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACANP16112 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACANP16112 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACANP16112 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACANP16112 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACANP16112 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACANP16112 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACANP16112 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACANP16112 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACANP16112 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACANP16112 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACANP16112 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACANP16112 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACANP16112 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACANP16112 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACANP16112 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ACANP16112 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACANP16112 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACANP16112 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ACANP16112 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACANP16112 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACANP16112 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACANP16112 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACANP16112 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms