Protein–RNA interactions for Protein: P15622

ZNF250, Zinc finger protein 250, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF250P15622 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF250P15622 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF250P15622 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF250P15622 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF250P15622 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF250P15622 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF250P15622 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF250P15622 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF250P15622 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF250P15622 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF250P15622 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF250P15622 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF250P15622 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF250P15622 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF250P15622 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF250P15622 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF250P15622 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF250P15622 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF250P15622 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF250P15622 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF250P15622 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF250P15622 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF250P15622 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF250P15622 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF250P15622 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF250P15622 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF250P15622 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF250P15622 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF250P15622 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF250P15622 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF250P15622 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF250P15622 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF250P15622 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF250P15622 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF250P15622 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF250P15622 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF250P15622 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF250P15622 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF250P15622 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF250P15622 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF250P15622 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF250P15622 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF250P15622 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF250P15622 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF250P15622 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF250P15622 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF250P15622 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF250P15622 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF250P15622 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF250P15622 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF250P15622 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF250P15622 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF250P15622 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF250P15622 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF250P15622 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF250P15622 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF250P15622 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF250P15622 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF250P15622 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF250P15622 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF250P15622 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF250P15622 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF250P15622 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF250P15622 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF250P15622 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF250P15622 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF250P15622 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF250P15622 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF250P15622 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF250P15622 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF250P15622 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF250P15622 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF250P15622 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF250P15622 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF250P15622 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF250P15622 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF250P15622 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF250P15622 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF250P15622 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF250P15622 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF250P15622 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF250P15622 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF250P15622 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF250P15622 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF250P15622 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF250P15622 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF250P15622 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF250P15622 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF250P15622 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF250P15622 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF250P15622 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF250P15622 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF250P15622 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF250P15622 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF250P15622 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF250P15622 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZNF250P15622 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF250P15622 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF250P15622 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF250P15622 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms