Protein–RNA interactions for Protein: P15508

Sptb, Spectrin beta chain, erythrocytic, mousemouse

Predictions only

Length 2,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptbP15508 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SptbP15508 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SptbP15508 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SptbP15508 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SptbP15508 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SptbP15508 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SptbP15508 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SptbP15508 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SptbP15508 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SptbP15508 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SptbP15508 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SptbP15508 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SptbP15508 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SptbP15508 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SptbP15508 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SptbP15508 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SptbP15508 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SptbP15508 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SptbP15508 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SptbP15508 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SptbP15508 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SptbP15508 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SptbP15508 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SptbP15508 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SptbP15508 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SptbP15508 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SptbP15508 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SptbP15508 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SptbP15508 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SptbP15508 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SptbP15508 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SptbP15508 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SptbP15508 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SptbP15508 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SptbP15508 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SptbP15508 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SptbP15508 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SptbP15508 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SptbP15508 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SptbP15508 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SptbP15508 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SptbP15508 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SptbP15508 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SptbP15508 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SptbP15508 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SptbP15508 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SptbP15508 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SptbP15508 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SptbP15508 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SptbP15508 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SptbP15508 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SptbP15508 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SptbP15508 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SptbP15508 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SptbP15508 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SptbP15508 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SptbP15508 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SptbP15508 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SptbP15508 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SptbP15508 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SptbP15508 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SptbP15508 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SptbP15508 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SptbP15508 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SptbP15508 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SptbP15508 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SptbP15508 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SptbP15508 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SptbP15508 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SptbP15508 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SptbP15508 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SptbP15508 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SptbP15508 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SptbP15508 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SptbP15508 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SptbP15508 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SptbP15508 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SptbP15508 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SptbP15508 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SptbP15508 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SptbP15508 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SptbP15508 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SptbP15508 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SptbP15508 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SptbP15508 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SptbP15508 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SptbP15508 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SptbP15508 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SptbP15508 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SptbP15508 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SptbP15508 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SptbP15508 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SptbP15508 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SptbP15508 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SptbP15508 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SptbP15508 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SptbP15508 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SptbP15508 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SptbP15508 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SptbP15508 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms