Protein–RNA interactions for Protein: P15374

UCHL3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UCHL3P15374 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UCHL3P15374 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
UCHL3P15374 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
UCHL3P15374 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
UCHL3P15374 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
UCHL3P15374 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
UCHL3P15374 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
UCHL3P15374 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
UCHL3P15374 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
UCHL3P15374 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
UCHL3P15374 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
UCHL3P15374 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
UCHL3P15374 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
UCHL3P15374 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
UCHL3P15374 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
UCHL3P15374 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UCHL3P15374 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UCHL3P15374 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UCHL3P15374 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UCHL3P15374 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UCHL3P15374 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UCHL3P15374 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
UCHL3P15374 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
UCHL3P15374 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
UCHL3P15374 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
UCHL3P15374 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UCHL3P15374 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UCHL3P15374 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UCHL3P15374 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UCHL3P15374 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UCHL3P15374 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UCHL3P15374 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UCHL3P15374 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UCHL3P15374 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UCHL3P15374 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UCHL3P15374 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UCHL3P15374 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
UCHL3P15374 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UCHL3P15374 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UCHL3P15374 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UCHL3P15374 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UCHL3P15374 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UCHL3P15374 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UCHL3P15374 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UCHL3P15374 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
UCHL3P15374 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UCHL3P15374 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UCHL3P15374 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UCHL3P15374 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UCHL3P15374 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
UCHL3P15374 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
UCHL3P15374 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UCHL3P15374 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
UCHL3P15374 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
UCHL3P15374 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UCHL3P15374 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UCHL3P15374 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
UCHL3P15374 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.55■■■□□ 2
UCHL3P15374 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UCHL3P15374 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
UCHL3P15374 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
UCHL3P15374 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
UCHL3P15374 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UCHL3P15374 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.54■■■□□ 2
UCHL3P15374 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UCHL3P15374 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
UCHL3P15374 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.53■■■□□ 2
UCHL3P15374 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
UCHL3P15374 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UCHL3P15374 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
UCHL3P15374 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UCHL3P15374 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.52■■■□□ 2
UCHL3P15374 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UCHL3P15374 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UCHL3P15374 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.52■■■□□ 2
UCHL3P15374 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
UCHL3P15374 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UCHL3P15374 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UCHL3P15374 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UCHL3P15374 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
UCHL3P15374 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UCHL3P15374 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UCHL3P15374 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
UCHL3P15374 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UCHL3P15374 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UCHL3P15374 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UCHL3P15374 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UCHL3P15374 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UCHL3P15374 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UCHL3P15374 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UCHL3P15374 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UCHL3P15374 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UCHL3P15374 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
UCHL3P15374 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UCHL3P15374 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UCHL3P15374 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UCHL3P15374 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
UCHL3P15374 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UCHL3P15374 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
UCHL3P15374 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms