Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPBP14678 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPBP14678 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPBP14678 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPBP14678 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPBP14678 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPBP14678 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPBP14678 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPBP14678 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPBP14678 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPBP14678 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPBP14678 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPBP14678 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPBP14678 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPBP14678 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPBP14678 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPBP14678 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPBP14678 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPBP14678 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPBP14678 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPBP14678 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPBP14678 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPBP14678 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPBP14678 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPBP14678 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPBP14678 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPBP14678 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPBP14678 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPBP14678 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPBP14678 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SNRPBP14678 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPBP14678 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPBP14678 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPBP14678 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRPBP14678 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRPBP14678 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRPBP14678 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRPBP14678 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRPBP14678 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRPBP14678 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRPBP14678 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRPBP14678 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRPBP14678 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRPBP14678 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPBP14678 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPBP14678 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPBP14678 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPBP14678 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPBP14678 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPBP14678 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPBP14678 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPBP14678 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPBP14678 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPBP14678 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPBP14678 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPBP14678 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPBP14678 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPBP14678 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPBP14678 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNRPBP14678 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPBP14678 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPBP14678 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPBP14678 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPBP14678 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPBP14678 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPBP14678 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPBP14678 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPBP14678 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPBP14678 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPBP14678 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPBP14678 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPBP14678 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPBP14678 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPBP14678 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPBP14678 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPBP14678 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPBP14678 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPBP14678 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPBP14678 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRPBP14678 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRPBP14678 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRPBP14678 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRPBP14678 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRPBP14678 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRPBP14678 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNRPBP14678 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPBP14678 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPBP14678 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPBP14678 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPBP14678 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPBP14678 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPBP14678 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPBP14678 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPBP14678 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPBP14678 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPBP14678 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPBP14678 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPBP14678 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPBP14678 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPBP14678 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms