Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Dnmt1P13864 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
Dnmt1P13864 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Dnmt1P13864 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Dnmt1P13864 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Dnmt1P13864 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Dnmt1P13864 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Dnmt1P13864 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Dnmt1P13864 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Dnmt1P13864 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Dnmt1P13864 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
Dnmt1P13864 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Dnmt1P13864 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Dnmt1P13864 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Dnmt1P13864 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Dnmt1P13864 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
Dnmt1P13864 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Dnmt1P13864 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Dnmt1P13864 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Dnmt1P13864 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Dnmt1P13864 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Dnmt1P13864 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Dnmt1P13864 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Dnmt1P13864 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
Dnmt1P13864 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
Dnmt1P13864 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Dnmt1P13864 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Dnmt1P13864 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Dnmt1P13864 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Dnmt1P13864 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Dnmt1P13864 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Dnmt1P13864 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Dnmt1P13864 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Dnmt1P13864 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Dnmt1P13864 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Dnmt1P13864 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Dnmt1P13864 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Dnmt1P13864 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Dnmt1P13864 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
Dnmt1P13864 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Dnmt1P13864 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Dnmt1P13864 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Dnmt1P13864 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Dnmt1P13864 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
Dnmt1P13864 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Dnmt1P13864 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Dnmt1P13864 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Dnmt1P13864 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Dnmt1P13864 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Dnmt1P13864 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Dnmt1P13864 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Dnmt1P13864 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Dnmt1P13864 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Dnmt1P13864 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Dnmt1P13864 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
Dnmt1P13864 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Dnmt1P13864 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
Dnmt1P13864 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Dnmt1P13864 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
Dnmt1P13864 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Dnmt1P13864 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Dnmt1P13864 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
Dnmt1P13864 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Dnmt1P13864 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
Dnmt1P13864 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Dnmt1P13864 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Dnmt1P13864 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Dnmt1P13864 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Dnmt1P13864 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Dnmt1P13864 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Dnmt1P13864 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Dnmt1P13864 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
Dnmt1P13864 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Dnmt1P13864 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Dnmt1P13864 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Dnmt1P13864 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Dnmt1P13864 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Dnmt1P13864 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Dnmt1P13864 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Dnmt1P13864 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Dnmt1P13864 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
Dnmt1P13864 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Dnmt1P13864 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Dnmt1P13864 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Dnmt1P13864 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
Dnmt1P13864 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Dnmt1P13864 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Dnmt1P13864 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Dnmt1P13864 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
Dnmt1P13864 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Dnmt1P13864 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Dnmt1P13864 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Dnmt1P13864 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Dnmt1P13864 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
Dnmt1P13864 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Dnmt1P13864 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Dnmt1P13864 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Dnmt1P13864 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Dnmt1P13864 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Dnmt1P13864 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms