Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL2P13500 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL2P13500 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL2P13500 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL2P13500 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL2P13500 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL2P13500 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL2P13500 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL2P13500 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL2P13500 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL2P13500 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL2P13500 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL2P13500 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL2P13500 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL2P13500 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL2P13500 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL2P13500 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL2P13500 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL2P13500 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCL2P13500 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL2P13500 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL2P13500 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL2P13500 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL2P13500 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL2P13500 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL2P13500 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL2P13500 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL2P13500 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL2P13500 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL2P13500 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL2P13500 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL2P13500 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL2P13500 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL2P13500 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCL2P13500 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCL2P13500 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCL2P13500 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCL2P13500 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCL2P13500 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCL2P13500 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCL2P13500 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCL2P13500 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCL2P13500 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCL2P13500 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCL2P13500 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCL2P13500 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCL2P13500 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCL2P13500 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL2P13500 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL2P13500 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL2P13500 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL2P13500 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL2P13500 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL2P13500 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL2P13500 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL2P13500 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL2P13500 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL2P13500 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL2P13500 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCL2P13500 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCL2P13500 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCL2P13500 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL2P13500 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL2P13500 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL2P13500 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL2P13500 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL2P13500 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL2P13500 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL2P13500 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL2P13500 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL2P13500 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL2P13500 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL2P13500 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCL2P13500 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL2P13500 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL2P13500 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL2P13500 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL2P13500 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL2P13500 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL2P13500 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL2P13500 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL2P13500 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL2P13500 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL2P13500 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL2P13500 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL2P13500 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL2P13500 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL2P13500 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL2P13500 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL2P13500 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL2P13500 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL2P13500 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL2P13500 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL2P13500 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL2P13500 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL2P13500 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL2P13500 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL2P13500 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL2P13500 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL2P13500 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122 ms