Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vpreb1P13372 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vpreb1P13372 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vpreb1P13372 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vpreb1P13372 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vpreb1P13372 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vpreb1P13372 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vpreb1P13372 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vpreb1P13372 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vpreb1P13372 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vpreb1P13372 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vpreb1P13372 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vpreb1P13372 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vpreb1P13372 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Vpreb1P13372 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vpreb1P13372 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vpreb1P13372 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vpreb1P13372 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vpreb1P13372 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vpreb1P13372 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vpreb1P13372 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vpreb1P13372 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vpreb1P13372 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vpreb1P13372 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Vpreb1P13372 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vpreb1P13372 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Vpreb1P13372 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vpreb1P13372 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vpreb1P13372 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vpreb1P13372 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vpreb1P13372 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vpreb1P13372 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vpreb1P13372 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Vpreb1P13372 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vpreb1P13372 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vpreb1P13372 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vpreb1P13372 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vpreb1P13372 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vpreb1P13372 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vpreb1P13372 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vpreb1P13372 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vpreb1P13372 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vpreb1P13372 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vpreb1P13372 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vpreb1P13372 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vpreb1P13372 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vpreb1P13372 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vpreb1P13372 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vpreb1P13372 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vpreb1P13372 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vpreb1P13372 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vpreb1P13372 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vpreb1P13372 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vpreb1P13372 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Vpreb1P13372 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vpreb1P13372 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vpreb1P13372 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vpreb1P13372 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vpreb1P13372 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vpreb1P13372 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vpreb1P13372 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vpreb1P13372 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vpreb1P13372 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vpreb1P13372 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vpreb1P13372 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vpreb1P13372 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vpreb1P13372 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vpreb1P13372 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vpreb1P13372 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vpreb1P13372 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vpreb1P13372 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vpreb1P13372 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vpreb1P13372 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vpreb1P13372 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vpreb1P13372 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vpreb1P13372 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vpreb1P13372 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vpreb1P13372 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vpreb1P13372 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vpreb1P13372 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vpreb1P13372 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vpreb1P13372 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vpreb1P13372 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vpreb1P13372 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vpreb1P13372 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vpreb1P13372 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vpreb1P13372 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vpreb1P13372 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vpreb1P13372 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vpreb1P13372 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vpreb1P13372 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vpreb1P13372 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vpreb1P13372 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vpreb1P13372 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vpreb1P13372 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vpreb1P13372 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vpreb1P13372 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vpreb1P13372 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vpreb1P13372 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vpreb1P13372 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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