Protein–RNA interactions for Protein: P13346

Fosb, Protein fosB, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosbP13346 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FosbP13346 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FosbP13346 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FosbP13346 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FosbP13346 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FosbP13346 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FosbP13346 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FosbP13346 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FosbP13346 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FosbP13346 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
FosbP13346 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FosbP13346 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FosbP13346 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FosbP13346 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FosbP13346 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FosbP13346 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FosbP13346 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
FosbP13346 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FosbP13346 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FosbP13346 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FosbP13346 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FosbP13346 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
FosbP13346 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FosbP13346 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FosbP13346 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FosbP13346 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FosbP13346 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FosbP13346 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FosbP13346 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FosbP13346 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FosbP13346 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FosbP13346 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FosbP13346 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FosbP13346 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FosbP13346 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FosbP13346 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FosbP13346 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FosbP13346 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FosbP13346 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FosbP13346 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FosbP13346 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FosbP13346 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FosbP13346 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FosbP13346 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FosbP13346 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FosbP13346 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FosbP13346 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FosbP13346 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FosbP13346 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FosbP13346 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FosbP13346 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FosbP13346 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FosbP13346 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FosbP13346 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FosbP13346 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FosbP13346 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FosbP13346 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FosbP13346 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FosbP13346 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FosbP13346 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FosbP13346 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FosbP13346 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FosbP13346 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
FosbP13346 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FosbP13346 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FosbP13346 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FosbP13346 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FosbP13346 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FosbP13346 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
FosbP13346 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FosbP13346 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FosbP13346 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FosbP13346 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FosbP13346 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FosbP13346 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FosbP13346 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FosbP13346 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FosbP13346 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FosbP13346 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FosbP13346 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FosbP13346 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FosbP13346 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FosbP13346 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FosbP13346 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FosbP13346 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FosbP13346 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FosbP13346 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FosbP13346 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FosbP13346 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FosbP13346 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FosbP13346 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FosbP13346 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FosbP13346 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FosbP13346 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FosbP13346 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FosbP13346 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FosbP13346 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
FosbP13346 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FosbP13346 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FosbP13346 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms