Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
COL11A1P12107 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
COL11A1P12107 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
COL11A1P12107 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
COL11A1P12107 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
COL11A1P12107 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
COL11A1P12107 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
COL11A1P12107 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
COL11A1P12107 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
COL11A1P12107 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
COL11A1P12107 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
COL11A1P12107 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
COL11A1P12107 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
COL11A1P12107 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
COL11A1P12107 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
COL11A1P12107 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
COL11A1P12107 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
COL11A1P12107 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
COL11A1P12107 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
COL11A1P12107 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
COL11A1P12107 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
COL11A1P12107 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
COL11A1P12107 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
COL11A1P12107 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
COL11A1P12107 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
COL11A1P12107 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
COL11A1P12107 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
COL11A1P12107 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
COL11A1P12107 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
COL11A1P12107 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
COL11A1P12107 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
COL11A1P12107 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
COL11A1P12107 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
COL11A1P12107 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
COL11A1P12107 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
COL11A1P12107 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
COL11A1P12107 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
COL11A1P12107 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.33
COL11A1P12107 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
COL11A1P12107 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
COL11A1P12107 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
COL11A1P12107 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
COL11A1P12107 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
COL11A1P12107 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
COL11A1P12107 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
COL11A1P12107 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
COL11A1P12107 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
COL11A1P12107 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
COL11A1P12107 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
COL11A1P12107 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
COL11A1P12107 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
COL11A1P12107 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
COL11A1P12107 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
COL11A1P12107 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
COL11A1P12107 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
COL11A1P12107 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
COL11A1P12107 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
COL11A1P12107 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
COL11A1P12107 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
COL11A1P12107 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
COL11A1P12107 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
COL11A1P12107 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
COL11A1P12107 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
COL11A1P12107 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
COL11A1P12107 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
COL11A1P12107 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
COL11A1P12107 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
COL11A1P12107 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
COL11A1P12107 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
COL11A1P12107 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
COL11A1P12107 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
COL11A1P12107 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
COL11A1P12107 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
COL11A1P12107 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
COL11A1P12107 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
COL11A1P12107 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
COL11A1P12107 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
COL11A1P12107 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
COL11A1P12107 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
COL11A1P12107 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
COL11A1P12107 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
COL11A1P12107 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
COL11A1P12107 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
COL11A1P12107 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
COL11A1P12107 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
COL11A1P12107 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
COL11A1P12107 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
COL11A1P12107 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
COL11A1P12107 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
COL11A1P12107 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
COL11A1P12107 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
COL11A1P12107 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
COL11A1P12107 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
COL11A1P12107 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
COL11A1P12107 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
COL11A1P12107 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
COL11A1P12107 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
COL11A1P12107 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
COL11A1P12107 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
COL11A1P12107 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms