Protein–RNA interactions for Protein: P12025

Mdk, Midkine, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MdkP12025 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MdkP12025 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MdkP12025 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MdkP12025 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MdkP12025 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MdkP12025 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MdkP12025 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MdkP12025 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MdkP12025 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MdkP12025 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MdkP12025 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MdkP12025 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MdkP12025 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MdkP12025 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MdkP12025 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MdkP12025 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MdkP12025 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MdkP12025 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MdkP12025 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MdkP12025 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MdkP12025 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MdkP12025 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MdkP12025 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MdkP12025 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MdkP12025 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MdkP12025 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MdkP12025 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MdkP12025 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MdkP12025 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MdkP12025 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MdkP12025 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MdkP12025 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MdkP12025 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MdkP12025 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MdkP12025 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MdkP12025 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MdkP12025 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MdkP12025 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MdkP12025 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MdkP12025 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MdkP12025 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MdkP12025 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MdkP12025 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MdkP12025 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MdkP12025 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MdkP12025 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MdkP12025 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MdkP12025 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MdkP12025 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MdkP12025 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MdkP12025 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MdkP12025 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MdkP12025 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MdkP12025 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MdkP12025 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MdkP12025 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MdkP12025 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MdkP12025 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MdkP12025 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MdkP12025 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MdkP12025 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MdkP12025 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MdkP12025 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MdkP12025 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MdkP12025 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MdkP12025 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MdkP12025 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MdkP12025 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MdkP12025 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MdkP12025 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MdkP12025 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MdkP12025 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MdkP12025 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MdkP12025 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MdkP12025 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MdkP12025 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MdkP12025 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MdkP12025 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MdkP12025 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MdkP12025 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MdkP12025 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MdkP12025 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MdkP12025 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MdkP12025 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MdkP12025 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MdkP12025 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MdkP12025 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MdkP12025 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MdkP12025 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MdkP12025 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MdkP12025 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MdkP12025 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MdkP12025 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MdkP12025 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MdkP12025 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MdkP12025 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MdkP12025 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MdkP12025 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MdkP12025 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MdkP12025 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.6 ms