Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPREB1P12018 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPREB1P12018 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VPREB1P12018 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPREB1P12018 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPREB1P12018 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPREB1P12018 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPREB1P12018 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPREB1P12018 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPREB1P12018 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPREB1P12018 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPREB1P12018 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPREB1P12018 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VPREB1P12018 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPREB1P12018 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPREB1P12018 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPREB1P12018 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VPREB1P12018 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPREB1P12018 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPREB1P12018 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPREB1P12018 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPREB1P12018 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPREB1P12018 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPREB1P12018 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VPREB1P12018 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VPREB1P12018 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VPREB1P12018 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
VPREB1P12018 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
VPREB1P12018 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VPREB1P12018 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VPREB1P12018 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VPREB1P12018 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VPREB1P12018 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VPREB1P12018 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPREB1P12018 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPREB1P12018 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPREB1P12018 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPREB1P12018 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPREB1P12018 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPREB1P12018 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPREB1P12018 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPREB1P12018 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPREB1P12018 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPREB1P12018 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPREB1P12018 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VPREB1P12018 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPREB1P12018 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPREB1P12018 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPREB1P12018 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VPREB1P12018 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPREB1P12018 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPREB1P12018 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPREB1P12018 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPREB1P12018 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPREB1P12018 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPREB1P12018 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPREB1P12018 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPREB1P12018 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPREB1P12018 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPREB1P12018 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPREB1P12018 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPREB1P12018 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPREB1P12018 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPREB1P12018 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPREB1P12018 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPREB1P12018 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPREB1P12018 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VPREB1P12018 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPREB1P12018 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPREB1P12018 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPREB1P12018 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPREB1P12018 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPREB1P12018 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPREB1P12018 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPREB1P12018 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VPREB1P12018 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VPREB1P12018 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VPREB1P12018 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VPREB1P12018 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VPREB1P12018 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VPREB1P12018 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VPREB1P12018 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VPREB1P12018 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VPREB1P12018 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VPREB1P12018 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VPREB1P12018 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
VPREB1P12018 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VPREB1P12018 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VPREB1P12018 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VPREB1P12018 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VPREB1P12018 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VPREB1P12018 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VPREB1P12018 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VPREB1P12018 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VPREB1P12018 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VPREB1P12018 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VPREB1P12018 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VPREB1P12018 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VPREB1P12018 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VPREB1P12018 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms