Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fv4P11370 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fv4P11370 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fv4P11370 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Fv4P11370 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fv4P11370 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fv4P11370 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fv4P11370 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fv4P11370 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fv4P11370 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fv4P11370 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fv4P11370 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fv4P11370 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fv4P11370 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fv4P11370 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fv4P11370 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fv4P11370 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fv4P11370 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fv4P11370 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fv4P11370 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fv4P11370 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fv4P11370 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fv4P11370 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fv4P11370 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fv4P11370 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fv4P11370 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fv4P11370 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fv4P11370 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fv4P11370 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fv4P11370 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fv4P11370 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fv4P11370 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fv4P11370 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fv4P11370 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fv4P11370 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fv4P11370 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fv4P11370 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fv4P11370 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fv4P11370 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fv4P11370 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fv4P11370 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fv4P11370 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fv4P11370 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fv4P11370 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Fv4P11370 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Fv4P11370 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fv4P11370 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fv4P11370 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fv4P11370 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fv4P11370 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fv4P11370 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fv4P11370 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fv4P11370 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fv4P11370 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Fv4P11370 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fv4P11370 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fv4P11370 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fv4P11370 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fv4P11370 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fv4P11370 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fv4P11370 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fv4P11370 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fv4P11370 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fv4P11370 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fv4P11370 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fv4P11370 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fv4P11370 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fv4P11370 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fv4P11370 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fv4P11370 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fv4P11370 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fv4P11370 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fv4P11370 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fv4P11370 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fv4P11370 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fv4P11370 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fv4P11370 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fv4P11370 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fv4P11370 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fv4P11370 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fv4P11370 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fv4P11370 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fv4P11370 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fv4P11370 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fv4P11370 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fv4P11370 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fv4P11370 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fv4P11370 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fv4P11370 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fv4P11370 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fv4P11370 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fv4P11370 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fv4P11370 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fv4P11370 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fv4P11370 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fv4P11370 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fv4P11370 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fv4P11370 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fv4P11370 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fv4P11370 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms