Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
P10404 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
P10404 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
P10404 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
P10404 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
P10404 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
P10404 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
P10404 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
P10404 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
P10404 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
P10404 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
P10404 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
P10404 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
P10404 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
P10404 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
P10404 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
P10404 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
P10404 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
P10404 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
P10404 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
P10404 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
P10404 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
P10404 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
P10404 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
P10404 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
P10404 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
P10404 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
P10404 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
P10404 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
P10404 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
P10404 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
P10404 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
P10404 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
P10404 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
P10404 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
P10404 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
P10404 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
P10404 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
P10404 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
P10404 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
P10404 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
P10404 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
P10404 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
P10404 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
P10404 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
P10404 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
P10404 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
P10404 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
P10404 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
P10404 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
P10404 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
P10404 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
P10404 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
P10404 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
P10404 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
P10404 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
P10404 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
P10404 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
P10404 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
P10404 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
P10404 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
P10404 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
P10404 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
P10404 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
P10404 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
P10404 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
P10404 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
P10404 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
P10404 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
P10404 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
P10404 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
P10404 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
P10404 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
P10404 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
P10404 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
P10404 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
P10404 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
P10404 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
P10404 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
P10404 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
P10404 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
P10404 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
P10404 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
P10404 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
P10404 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
P10404 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
P10404 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
P10404 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
P10404 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
P10404 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
P10404 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
P10404 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
P10404 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
P10404 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
P10404 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
P10404 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
P10404 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
P10404 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
P10404 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
P10404 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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