Protein–RNA interactions for Protein: P0DJ93

SMIM13, Small integral membrane protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM13P0DJ93 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM13P0DJ93 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM13P0DJ93 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM13P0DJ93 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM13P0DJ93 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM13P0DJ93 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM13P0DJ93 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM13P0DJ93 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM13P0DJ93 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM13P0DJ93 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM13P0DJ93 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM13P0DJ93 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM13P0DJ93 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM13P0DJ93 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM13P0DJ93 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM13P0DJ93 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM13P0DJ93 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM13P0DJ93 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM13P0DJ93 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM13P0DJ93 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM13P0DJ93 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM13P0DJ93 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM13P0DJ93 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM13P0DJ93 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM13P0DJ93 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM13P0DJ93 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM13P0DJ93 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM13P0DJ93 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM13P0DJ93 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM13P0DJ93 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM13P0DJ93 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM13P0DJ93 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM13P0DJ93 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM13P0DJ93 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM13P0DJ93 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM13P0DJ93 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM13P0DJ93 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM13P0DJ93 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM13P0DJ93 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM13P0DJ93 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM13P0DJ93 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM13P0DJ93 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM13P0DJ93 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM13P0DJ93 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM13P0DJ93 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM13P0DJ93 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM13P0DJ93 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM13P0DJ93 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM13P0DJ93 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM13P0DJ93 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM13P0DJ93 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM13P0DJ93 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM13P0DJ93 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM13P0DJ93 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM13P0DJ93 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM13P0DJ93 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM13P0DJ93 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM13P0DJ93 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM13P0DJ93 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM13P0DJ93 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM13P0DJ93 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM13P0DJ93 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM13P0DJ93 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM13P0DJ93 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM13P0DJ93 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM13P0DJ93 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM13P0DJ93 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM13P0DJ93 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM13P0DJ93 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM13P0DJ93 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM13P0DJ93 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM13P0DJ93 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMIM13P0DJ93 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMIM13P0DJ93 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM13P0DJ93 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM13P0DJ93 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM13P0DJ93 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM13P0DJ93 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM13P0DJ93 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM13P0DJ93 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM13P0DJ93 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM13P0DJ93 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM13P0DJ93 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM13P0DJ93 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM13P0DJ93 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM13P0DJ93 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM13P0DJ93 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM13P0DJ93 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM13P0DJ93 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM13P0DJ93 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM13P0DJ93 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM13P0DJ93 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM13P0DJ93 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM13P0DJ93 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM13P0DJ93 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM13P0DJ93 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM13P0DJ93 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM13P0DJ93 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM13P0DJ93 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM13P0DJ93 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms