Protein–RNA interactions for Protein: P0CG20

PRR35, Proline-rich protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR35P0CG20 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRR35P0CG20 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRR35P0CG20 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRR35P0CG20 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRR35P0CG20 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRR35P0CG20 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRR35P0CG20 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRR35P0CG20 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRR35P0CG20 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRR35P0CG20 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRR35P0CG20 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRR35P0CG20 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRR35P0CG20 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRR35P0CG20 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRR35P0CG20 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PRR35P0CG20 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRR35P0CG20 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRR35P0CG20 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRR35P0CG20 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRR35P0CG20 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRR35P0CG20 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRR35P0CG20 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRR35P0CG20 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRR35P0CG20 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRR35P0CG20 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRR35P0CG20 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRR35P0CG20 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRR35P0CG20 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRR35P0CG20 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRR35P0CG20 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRR35P0CG20 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRR35P0CG20 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRR35P0CG20 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRR35P0CG20 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRR35P0CG20 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRR35P0CG20 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRR35P0CG20 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRR35P0CG20 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRR35P0CG20 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRR35P0CG20 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRR35P0CG20 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRR35P0CG20 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRR35P0CG20 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRR35P0CG20 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRR35P0CG20 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRR35P0CG20 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRR35P0CG20 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRR35P0CG20 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PRR35P0CG20 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRR35P0CG20 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRR35P0CG20 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRR35P0CG20 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRR35P0CG20 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRR35P0CG20 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRR35P0CG20 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRR35P0CG20 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRR35P0CG20 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRR35P0CG20 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRR35P0CG20 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRR35P0CG20 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRR35P0CG20 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRR35P0CG20 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PRR35P0CG20 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRR35P0CG20 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRR35P0CG20 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRR35P0CG20 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRR35P0CG20 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRR35P0CG20 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRR35P0CG20 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRR35P0CG20 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRR35P0CG20 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRR35P0CG20 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRR35P0CG20 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRR35P0CG20 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRR35P0CG20 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRR35P0CG20 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRR35P0CG20 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRR35P0CG20 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRR35P0CG20 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRR35P0CG20 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRR35P0CG20 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRR35P0CG20 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRR35P0CG20 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRR35P0CG20 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRR35P0CG20 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRR35P0CG20 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRR35P0CG20 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRR35P0CG20 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRR35P0CG20 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRR35P0CG20 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRR35P0CG20 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRR35P0CG20 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRR35P0CG20 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRR35P0CG20 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRR35P0CG20 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRR35P0CG20 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRR35P0CG20 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRR35P0CG20 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRR35P0CG20 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRR35P0CG20 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms