Protein–RNA interactions for Protein: P0C8K7

Smim1, Small integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim1P0C8K7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim1P0C8K7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim1P0C8K7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim1P0C8K7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim1P0C8K7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim1P0C8K7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim1P0C8K7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim1P0C8K7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim1P0C8K7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim1P0C8K7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim1P0C8K7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smim1P0C8K7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim1P0C8K7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim1P0C8K7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim1P0C8K7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim1P0C8K7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim1P0C8K7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim1P0C8K7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim1P0C8K7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim1P0C8K7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim1P0C8K7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim1P0C8K7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim1P0C8K7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim1P0C8K7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim1P0C8K7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim1P0C8K7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim1P0C8K7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim1P0C8K7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim1P0C8K7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim1P0C8K7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim1P0C8K7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim1P0C8K7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim1P0C8K7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim1P0C8K7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim1P0C8K7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim1P0C8K7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim1P0C8K7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim1P0C8K7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim1P0C8K7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim1P0C8K7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim1P0C8K7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smim1P0C8K7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smim1P0C8K7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim1P0C8K7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim1P0C8K7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim1P0C8K7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim1P0C8K7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim1P0C8K7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim1P0C8K7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim1P0C8K7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim1P0C8K7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim1P0C8K7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim1P0C8K7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim1P0C8K7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim1P0C8K7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim1P0C8K7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim1P0C8K7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim1P0C8K7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim1P0C8K7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim1P0C8K7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim1P0C8K7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim1P0C8K7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim1P0C8K7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim1P0C8K7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim1P0C8K7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim1P0C8K7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim1P0C8K7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim1P0C8K7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim1P0C8K7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim1P0C8K7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim1P0C8K7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim1P0C8K7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim1P0C8K7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim1P0C8K7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim1P0C8K7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim1P0C8K7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim1P0C8K7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim1P0C8K7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim1P0C8K7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim1P0C8K7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim1P0C8K7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim1P0C8K7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim1P0C8K7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim1P0C8K7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim1P0C8K7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim1P0C8K7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim1P0C8K7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim1P0C8K7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim1P0C8K7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim1P0C8K7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim1P0C8K7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim1P0C8K7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim1P0C8K7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim1P0C8K7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim1P0C8K7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim1P0C8K7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim1P0C8K7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim1P0C8K7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim1P0C8K7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim1P0C8K7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms