Protein–RNA interactions for Protein: P0C7H9

USP17L7, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L7P0C7H9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP17L7P0C7H9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP17L7P0C7H9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP17L7P0C7H9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP17L7P0C7H9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP17L7P0C7H9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP17L7P0C7H9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP17L7P0C7H9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP17L7P0C7H9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP17L7P0C7H9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP17L7P0C7H9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP17L7P0C7H9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP17L7P0C7H9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP17L7P0C7H9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP17L7P0C7H9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP17L7P0C7H9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP17L7P0C7H9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP17L7P0C7H9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP17L7P0C7H9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP17L7P0C7H9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP17L7P0C7H9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP17L7P0C7H9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP17L7P0C7H9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
USP17L7P0C7H9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP17L7P0C7H9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP17L7P0C7H9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP17L7P0C7H9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP17L7P0C7H9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP17L7P0C7H9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
USP17L7P0C7H9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP17L7P0C7H9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP17L7P0C7H9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP17L7P0C7H9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L7P0C7H9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L7P0C7H9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L7P0C7H9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP17L7P0C7H9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP17L7P0C7H9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L7P0C7H9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L7P0C7H9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L7P0C7H9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP17L7P0C7H9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP17L7P0C7H9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP17L7P0C7H9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP17L7P0C7H9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP17L7P0C7H9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP17L7P0C7H9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP17L7P0C7H9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP17L7P0C7H9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP17L7P0C7H9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
USP17L7P0C7H9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP17L7P0C7H9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP17L7P0C7H9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP17L7P0C7H9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP17L7P0C7H9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP17L7P0C7H9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP17L7P0C7H9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP17L7P0C7H9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP17L7P0C7H9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP17L7P0C7H9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
USP17L7P0C7H9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP17L7P0C7H9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP17L7P0C7H9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP17L7P0C7H9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP17L7P0C7H9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
USP17L7P0C7H9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP17L7P0C7H9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP17L7P0C7H9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP17L7P0C7H9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP17L7P0C7H9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP17L7P0C7H9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP17L7P0C7H9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP17L7P0C7H9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
USP17L7P0C7H9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
USP17L7P0C7H9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP17L7P0C7H9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP17L7P0C7H9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP17L7P0C7H9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP17L7P0C7H9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP17L7P0C7H9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP17L7P0C7H9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP17L7P0C7H9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP17L7P0C7H9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP17L7P0C7H9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP17L7P0C7H9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
USP17L7P0C7H9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP17L7P0C7H9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP17L7P0C7H9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP17L7P0C7H9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP17L7P0C7H9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP17L7P0C7H9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP17L7P0C7H9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP17L7P0C7H9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP17L7P0C7H9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP17L7P0C7H9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
USP17L7P0C7H9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP17L7P0C7H9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
USP17L7P0C7H9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP17L7P0C7H9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP17L7P0C7H9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.5 ms