Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC175P0C221 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC175P0C221 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC175P0C221 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC175P0C221 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC175P0C221 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC175P0C221 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC175P0C221 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC175P0C221 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC175P0C221 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC175P0C221 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC175P0C221 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC175P0C221 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC175P0C221 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC175P0C221 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC175P0C221 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC175P0C221 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC175P0C221 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC175P0C221 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC175P0C221 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC175P0C221 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC175P0C221 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC175P0C221 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC175P0C221 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC175P0C221 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC175P0C221 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC175P0C221 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC175P0C221 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC175P0C221 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC175P0C221 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC175P0C221 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC175P0C221 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC175P0C221 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC175P0C221 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC175P0C221 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC175P0C221 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC175P0C221 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC175P0C221 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC175P0C221 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC175P0C221 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC175P0C221 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC175P0C221 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC175P0C221 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC175P0C221 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC175P0C221 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC175P0C221 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC175P0C221 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC175P0C221 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.51■■■□□ 2
CCDC175P0C221 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC175P0C221 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC175P0C221 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC175P0C221 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC175P0C221 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC175P0C221 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC175P0C221 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC175P0C221 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC175P0C221 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC175P0C221 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC175P0C221 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC175P0C221 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC175P0C221 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC175P0C221 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC175P0C221 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC175P0C221 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC175P0C221 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC175P0C221 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC175P0C221 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC175P0C221 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC175P0C221 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC175P0C221 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC175P0C221 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC175P0C221 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC175P0C221 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC175P0C221 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC175P0C221 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC175P0C221 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC175P0C221 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC175P0C221 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC175P0C221 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC175P0C221 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC175P0C221 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC175P0C221 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC175P0C221 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC175P0C221 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC175P0C221 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC175P0C221 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC175P0C221 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC175P0C221 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC175P0C221 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC175P0C221 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC175P0C221 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC175P0C221 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC175P0C221 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC175P0C221 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC175P0C221 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC175P0C221 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC175P0C221 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC175P0C221 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC175P0C221 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC175P0C221 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.5 ms