Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
C4BP0C0L5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
C4BP0C0L5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
C4BP0C0L5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
C4BP0C0L5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
C4BP0C0L5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
C4BP0C0L5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
C4BP0C0L5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
C4BP0C0L5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
C4BP0C0L5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
C4BP0C0L5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
C4BP0C0L5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
C4BP0C0L5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
C4BP0C0L5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
C4BP0C0L5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
C4BP0C0L5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
C4BP0C0L5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
C4BP0C0L5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
C4BP0C0L5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
C4BP0C0L5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
C4BP0C0L5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
C4BP0C0L5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
C4BP0C0L5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
C4BP0C0L5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
C4BP0C0L5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
C4BP0C0L5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
C4BP0C0L5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
C4BP0C0L5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
C4BP0C0L5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
C4BP0C0L5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
C4BP0C0L5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
C4BP0C0L5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
C4BP0C0L5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
C4BP0C0L5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
C4BP0C0L5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
C4BP0C0L5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
C4BP0C0L5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
C4BP0C0L5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
C4BP0C0L5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
C4BP0C0L5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
C4BP0C0L5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
C4BP0C0L5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
C4BP0C0L5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
C4BP0C0L5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
C4BP0C0L5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
C4BP0C0L5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
C4BP0C0L5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
C4BP0C0L5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
C4BP0C0L5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
C4BP0C0L5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
C4BP0C0L5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
C4BP0C0L5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
C4BP0C0L5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
C4BP0C0L5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
C4BP0C0L5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
C4BP0C0L5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
C4BP0C0L5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
C4BP0C0L5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
C4BP0C0L5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
C4BP0C0L5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
C4BP0C0L5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
C4BP0C0L5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
C4BP0C0L5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
C4BP0C0L5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
C4BP0C0L5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
C4BP0C0L5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
C4BP0C0L5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
C4BP0C0L5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
C4BP0C0L5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
C4BP0C0L5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
C4BP0C0L5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
C4BP0C0L5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
C4BP0C0L5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
C4BP0C0L5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
C4BP0C0L5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
C4BP0C0L5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
C4BP0C0L5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
C4BP0C0L5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
C4BP0C0L5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
C4BP0C0L5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
C4BP0C0L5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
C4BP0C0L5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
C4BP0C0L5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
C4BP0C0L5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
C4BP0C0L5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
C4BP0C0L5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
C4BP0C0L5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
C4BP0C0L5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
C4BP0C0L5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
C4BP0C0L5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
C4BP0C0L5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
C4BP0C0L5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
C4BP0C0L5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
C4BP0C0L5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
C4BP0C0L5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
C4BP0C0L5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
C4BP0C0L5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
C4BP0C0L5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
C4BP0C0L5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
C4BP0C0L5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms