Protein–RNA interactions for Protein: P09619

PDGFRB, Platelet-derived growth factor receptor beta, humanhuman

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Length 1,106 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRBP09619 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PDGFRBP09619 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDGFRBP09619 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDGFRBP09619 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDGFRBP09619 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PDGFRBP09619 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDGFRBP09619 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDGFRBP09619 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDGFRBP09619 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDGFRBP09619 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDGFRBP09619 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PDGFRBP09619 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDGFRBP09619 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PDGFRBP09619 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDGFRBP09619 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDGFRBP09619 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDGFRBP09619 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDGFRBP09619 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDGFRBP09619 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDGFRBP09619 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDGFRBP09619 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDGFRBP09619 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDGFRBP09619 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDGFRBP09619 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDGFRBP09619 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDGFRBP09619 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDGFRBP09619 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDGFRBP09619 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDGFRBP09619 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDGFRBP09619 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDGFRBP09619 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDGFRBP09619 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDGFRBP09619 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDGFRBP09619 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDGFRBP09619 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDGFRBP09619 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDGFRBP09619 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PDGFRBP09619 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDGFRBP09619 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDGFRBP09619 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PDGFRBP09619 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDGFRBP09619 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDGFRBP09619 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDGFRBP09619 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDGFRBP09619 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDGFRBP09619 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDGFRBP09619 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDGFRBP09619 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PDGFRBP09619 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDGFRBP09619 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDGFRBP09619 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDGFRBP09619 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDGFRBP09619 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDGFRBP09619 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDGFRBP09619 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDGFRBP09619 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDGFRBP09619 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDGFRBP09619 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PDGFRBP09619 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDGFRBP09619 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDGFRBP09619 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDGFRBP09619 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDGFRBP09619 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDGFRBP09619 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDGFRBP09619 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PDGFRBP09619 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDGFRBP09619 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDGFRBP09619 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDGFRBP09619 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDGFRBP09619 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDGFRBP09619 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PDGFRBP09619 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDGFRBP09619 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PDGFRBP09619 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDGFRBP09619 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDGFRBP09619 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDGFRBP09619 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDGFRBP09619 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDGFRBP09619 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDGFRBP09619 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDGFRBP09619 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDGFRBP09619 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDGFRBP09619 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDGFRBP09619 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDGFRBP09619 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDGFRBP09619 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDGFRBP09619 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDGFRBP09619 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDGFRBP09619 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDGFRBP09619 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDGFRBP09619 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDGFRBP09619 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PDGFRBP09619 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDGFRBP09619 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDGFRBP09619 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDGFRBP09619 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDGFRBP09619 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDGFRBP09619 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDGFRBP09619 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDGFRBP09619 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
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