Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACAA1P09110 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACAA1P09110 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACAA1P09110 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACAA1P09110 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACAA1P09110 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACAA1P09110 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACAA1P09110 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACAA1P09110 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACAA1P09110 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACAA1P09110 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ACAA1P09110 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACAA1P09110 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACAA1P09110 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACAA1P09110 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACAA1P09110 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACAA1P09110 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACAA1P09110 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACAA1P09110 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACAA1P09110 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACAA1P09110 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACAA1P09110 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACAA1P09110 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACAA1P09110 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACAA1P09110 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACAA1P09110 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACAA1P09110 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ACAA1P09110 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACAA1P09110 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACAA1P09110 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACAA1P09110 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACAA1P09110 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACAA1P09110 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACAA1P09110 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACAA1P09110 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACAA1P09110 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACAA1P09110 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACAA1P09110 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACAA1P09110 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACAA1P09110 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACAA1P09110 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACAA1P09110 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACAA1P09110 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACAA1P09110 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACAA1P09110 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACAA1P09110 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACAA1P09110 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACAA1P09110 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACAA1P09110 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACAA1P09110 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACAA1P09110 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACAA1P09110 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACAA1P09110 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ACAA1P09110 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACAA1P09110 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ACAA1P09110 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACAA1P09110 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACAA1P09110 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACAA1P09110 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACAA1P09110 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACAA1P09110 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACAA1P09110 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACAA1P09110 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACAA1P09110 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACAA1P09110 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACAA1P09110 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACAA1P09110 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACAA1P09110 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACAA1P09110 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACAA1P09110 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACAA1P09110 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACAA1P09110 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ACAA1P09110 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACAA1P09110 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACAA1P09110 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACAA1P09110 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACAA1P09110 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACAA1P09110 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACAA1P09110 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACAA1P09110 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACAA1P09110 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACAA1P09110 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACAA1P09110 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACAA1P09110 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACAA1P09110 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACAA1P09110 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACAA1P09110 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACAA1P09110 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACAA1P09110 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACAA1P09110 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACAA1P09110 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACAA1P09110 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACAA1P09110 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ACAA1P09110 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACAA1P09110 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACAA1P09110 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACAA1P09110 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACAA1P09110 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACAA1P09110 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACAA1P09110 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms