Protein–RNA interactions for Protein: P08708

RPS17, 40S ribosomal protein S17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS17P08708 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS17P08708 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS17P08708 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPS17P08708 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPS17P08708 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPS17P08708 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPS17P08708 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS17P08708 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS17P08708 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS17P08708 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS17P08708 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS17P08708 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPS17P08708 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPS17P08708 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPS17P08708 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS17P08708 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS17P08708 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS17P08708 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RPS17P08708 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPS17P08708 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS17P08708 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS17P08708 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS17P08708 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS17P08708 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS17P08708 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS17P08708 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS17P08708 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS17P08708 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPS17P08708 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPS17P08708 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPS17P08708 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS17P08708 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS17P08708 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS17P08708 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS17P08708 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS17P08708 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS17P08708 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RPS17P08708 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPS17P08708 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
RPS17P08708 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPS17P08708 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPS17P08708 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS17P08708 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS17P08708 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS17P08708 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS17P08708 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS17P08708 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS17P08708 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS17P08708 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS17P08708 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS17P08708 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS17P08708 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS17P08708 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS17P08708 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS17P08708 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS17P08708 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS17P08708 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS17P08708 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS17P08708 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS17P08708 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS17P08708 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS17P08708 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS17P08708 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS17P08708 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS17P08708 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS17P08708 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS17P08708 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS17P08708 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS17P08708 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS17P08708 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS17P08708 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS17P08708 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS17P08708 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS17P08708 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RPS17P08708 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS17P08708 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS17P08708 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS17P08708 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS17P08708 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS17P08708 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS17P08708 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS17P08708 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS17P08708 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS17P08708 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS17P08708 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS17P08708 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS17P08708 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS17P08708 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS17P08708 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS17P08708 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS17P08708 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS17P08708 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS17P08708 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS17P08708 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS17P08708 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPS17P08708 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPS17P08708 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPS17P08708 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPS17P08708 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPS17P08708 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms