Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col4a2P08122 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col4a2P08122 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col4a2P08122 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col4a2P08122 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col4a2P08122 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col4a2P08122 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col4a2P08122 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col4a2P08122 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col4a2P08122 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col4a2P08122 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col4a2P08122 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col4a2P08122 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col4a2P08122 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col4a2P08122 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col4a2P08122 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col4a2P08122 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col4a2P08122 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col4a2P08122 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col4a2P08122 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col4a2P08122 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col4a2P08122 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col4a2P08122 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Col4a2P08122 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col4a2P08122 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col4a2P08122 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col4a2P08122 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col4a2P08122 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col4a2P08122 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col4a2P08122 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col4a2P08122 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col4a2P08122 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col4a2P08122 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col4a2P08122 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col4a2P08122 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col4a2P08122 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col4a2P08122 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col4a2P08122 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Col4a2P08122 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col4a2P08122 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a2P08122 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a2P08122 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col4a2P08122 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col4a2P08122 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col4a2P08122 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col4a2P08122 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col4a2P08122 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col4a2P08122 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col4a2P08122 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col4a2P08122 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col4a2P08122 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col4a2P08122 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col4a2P08122 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col4a2P08122 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col4a2P08122 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Col4a2P08122 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Col4a2P08122 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col4a2P08122 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Col4a2P08122 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Col4a2P08122 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a2P08122 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a2P08122 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a2P08122 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a2P08122 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a2P08122 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a2P08122 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a2P08122 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a2P08122 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a2P08122 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a2P08122 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a2P08122 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Col4a2P08122 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col4a2P08122 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col4a2P08122 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col4a2P08122 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col4a2P08122 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Col4a2P08122 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a2P08122 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a2P08122 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a2P08122 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a2P08122 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a2P08122 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a2P08122 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col4a2P08122 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col4a2P08122 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a2P08122 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col4a2P08122 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a2P08122 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a2P08122 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col4a2P08122 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col4a2P08122 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Col4a2P08122 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col4a2P08122 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col4a2P08122 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col4a2P08122 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col4a2P08122 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col4a2P08122 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col4a2P08122 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Col4a2P08122 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col4a2P08122 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms