Protein–RNA interactions for Protein: P07911

UMOD, Uromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UMODP07911 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UMODP07911 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UMODP07911 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UMODP07911 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UMODP07911 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UMODP07911 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UMODP07911 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UMODP07911 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UMODP07911 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UMODP07911 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UMODP07911 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UMODP07911 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UMODP07911 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UMODP07911 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UMODP07911 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UMODP07911 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UMODP07911 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UMODP07911 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UMODP07911 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UMODP07911 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UMODP07911 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
UMODP07911 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UMODP07911 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UMODP07911 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UMODP07911 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UMODP07911 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UMODP07911 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UMODP07911 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UMODP07911 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UMODP07911 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UMODP07911 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UMODP07911 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UMODP07911 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UMODP07911 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UMODP07911 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UMODP07911 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UMODP07911 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UMODP07911 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UMODP07911 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UMODP07911 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UMODP07911 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UMODP07911 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UMODP07911 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24■■□□□ 1.43
UMODP07911 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UMODP07911 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UMODP07911 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UMODP07911 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UMODP07911 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UMODP07911 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UMODP07911 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UMODP07911 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UMODP07911 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UMODP07911 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UMODP07911 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UMODP07911 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UMODP07911 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UMODP07911 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UMODP07911 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UMODP07911 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UMODP07911 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UMODP07911 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UMODP07911 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UMODP07911 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UMODP07911 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UMODP07911 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UMODP07911 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UMODP07911 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UMODP07911 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
UMODP07911 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UMODP07911 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UMODP07911 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UMODP07911 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UMODP07911 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UMODP07911 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UMODP07911 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UMODP07911 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UMODP07911 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UMODP07911 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UMODP07911 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UMODP07911 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UMODP07911 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UMODP07911 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
UMODP07911 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UMODP07911 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UMODP07911 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UMODP07911 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UMODP07911 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UMODP07911 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UMODP07911 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UMODP07911 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UMODP07911 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UMODP07911 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UMODP07911 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UMODP07911 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UMODP07911 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UMODP07911 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UMODP07911 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UMODP07911 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UMODP07911 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UMODP07911 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms