Protein–RNA interactions for Protein: P07437

TUBB, Tubulin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBBP07437 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUBBP07437 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBBP07437 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBBP07437 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBBP07437 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBBP07437 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBBP07437 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TUBBP07437 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TUBBP07437 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TUBBP07437 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TUBBP07437 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TUBBP07437 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TUBBP07437 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TUBBP07437 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TUBBP07437 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TUBBP07437 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TUBBP07437 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TUBBP07437 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBBP07437 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBBP07437 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBBP07437 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBBP07437 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TUBBP07437 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TUBBP07437 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBBP07437 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBBP07437 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TUBBP07437 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUBBP07437 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUBBP07437 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TUBBP07437 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TUBBP07437 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TUBBP07437 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TUBBP07437 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TUBBP07437 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TUBBP07437 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TUBBP07437 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TUBBP07437 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TUBBP07437 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TUBBP07437 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TUBBP07437 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TUBBP07437 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TUBBP07437 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TUBBP07437 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TUBBP07437 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TUBBP07437 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TUBBP07437 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TUBBP07437 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBBP07437 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBBP07437 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBBP07437 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBBP07437 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBBP07437 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBBP07437 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBBP07437 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBBP07437 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBBP07437 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUBBP07437 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUBBP07437 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUBBP07437 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TUBBP07437 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUBBP07437 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TUBBP07437 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TUBBP07437 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TUBBP07437 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TUBBP07437 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TUBBP07437 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TUBBP07437 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUBBP07437 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUBBP07437 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUBBP07437 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUBBP07437 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUBBP07437 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TUBBP07437 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TUBBP07437 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUBBP07437 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUBBP07437 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUBBP07437 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TUBBP07437 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TUBBP07437 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TUBBP07437 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUBBP07437 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUBBP07437 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUBBP07437 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUBBP07437 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUBBP07437 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUBBP07437 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUBBP07437 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBBP07437 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBBP07437 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBBP07437 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBBP07437 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBBP07437 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBBP07437 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBBP07437 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBBP07437 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBBP07437 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBBP07437 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBBP07437 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBBP07437 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBBP07437 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms