Protein–RNA interactions for Protein: P07358

C8B, Complement component C8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8BP07358 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C8BP07358 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C8BP07358 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C8BP07358 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C8BP07358 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C8BP07358 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
C8BP07358 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C8BP07358 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C8BP07358 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C8BP07358 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C8BP07358 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C8BP07358 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C8BP07358 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
C8BP07358 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C8BP07358 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C8BP07358 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C8BP07358 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C8BP07358 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C8BP07358 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C8BP07358 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C8BP07358 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C8BP07358 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C8BP07358 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C8BP07358 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C8BP07358 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C8BP07358 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C8BP07358 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
C8BP07358 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
C8BP07358 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C8BP07358 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C8BP07358 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C8BP07358 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C8BP07358 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C8BP07358 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C8BP07358 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
C8BP07358 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C8BP07358 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C8BP07358 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C8BP07358 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C8BP07358 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C8BP07358 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C8BP07358 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C8BP07358 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C8BP07358 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C8BP07358 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
C8BP07358 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C8BP07358 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C8BP07358 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C8BP07358 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C8BP07358 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C8BP07358 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C8BP07358 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C8BP07358 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C8BP07358 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C8BP07358 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C8BP07358 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C8BP07358 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C8BP07358 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C8BP07358 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C8BP07358 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C8BP07358 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C8BP07358 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C8BP07358 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C8BP07358 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C8BP07358 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C8BP07358 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C8BP07358 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C8BP07358 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C8BP07358 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C8BP07358 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C8BP07358 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C8BP07358 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C8BP07358 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C8BP07358 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C8BP07358 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C8BP07358 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C8BP07358 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C8BP07358 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C8BP07358 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C8BP07358 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C8BP07358 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C8BP07358 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C8BP07358 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C8BP07358 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C8BP07358 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C8BP07358 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C8BP07358 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C8BP07358 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C8BP07358 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
C8BP07358 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C8BP07358 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C8BP07358 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C8BP07358 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C8BP07358 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C8BP07358 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C8BP07358 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C8BP07358 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C8BP07358 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C8BP07358 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C8BP07358 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms