Protein–RNA interactions for Protein: P07351

Ifna4, Interferon alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna4P07351 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ifna4P07351 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ifna4P07351 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ifna4P07351 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ifna4P07351 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ifna4P07351 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ifna4P07351 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ifna4P07351 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ifna4P07351 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ifna4P07351 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ifna4P07351 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ifna4P07351 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ifna4P07351 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ifna4P07351 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ifna4P07351 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ifna4P07351 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ifna4P07351 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ifna4P07351 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ifna4P07351 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ifna4P07351 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ifna4P07351 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ifna4P07351 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ifna4P07351 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ifna4P07351 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ifna4P07351 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ifna4P07351 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ifna4P07351 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ifna4P07351 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ifna4P07351 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ifna4P07351 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ifna4P07351 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ifna4P07351 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ifna4P07351 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ifna4P07351 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ifna4P07351 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ifna4P07351 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ifna4P07351 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ifna4P07351 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ifna4P07351 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ifna4P07351 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ifna4P07351 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ifna4P07351 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ifna4P07351 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ifna4P07351 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ifna4P07351 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ifna4P07351 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ifna4P07351 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ifna4P07351 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ifna4P07351 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ifna4P07351 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ifna4P07351 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ifna4P07351 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ifna4P07351 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ifna4P07351 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ifna4P07351 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ifna4P07351 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ifna4P07351 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ifna4P07351 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ifna4P07351 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ifna4P07351 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ifna4P07351 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ifna4P07351 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ifna4P07351 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ifna4P07351 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ifna4P07351 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ifna4P07351 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ifna4P07351 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ifna4P07351 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ifna4P07351 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ifna4P07351 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ifna4P07351 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ifna4P07351 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ifna4P07351 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ifna4P07351 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifna4P07351 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifna4P07351 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifna4P07351 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifna4P07351 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifna4P07351 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifna4P07351 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifna4P07351 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifna4P07351 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifna4P07351 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifna4P07351 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifna4P07351 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifna4P07351 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifna4P07351 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifna4P07351 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifna4P07351 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifna4P07351 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifna4P07351 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifna4P07351 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifna4P07351 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifna4P07351 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifna4P07351 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifna4P07351 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifna4P07351 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifna4P07351 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifna4P07351 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifna4P07351 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms