Protein–RNA interactions for Protein: P07141

Csf1, Macrophage colony-stimulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1P07141 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csf1P07141 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csf1P07141 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csf1P07141 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csf1P07141 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csf1P07141 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Csf1P07141 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Csf1P07141 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Csf1P07141 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csf1P07141 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Csf1P07141 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Csf1P07141 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Csf1P07141 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Csf1P07141 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Csf1P07141 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Csf1P07141 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Csf1P07141 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Csf1P07141 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Csf1P07141 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Csf1P07141 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Csf1P07141 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Csf1P07141 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Csf1P07141 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Csf1P07141 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Csf1P07141 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Csf1P07141 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Csf1P07141 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Csf1P07141 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Csf1P07141 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Csf1P07141 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Csf1P07141 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Csf1P07141 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Csf1P07141 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Csf1P07141 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Csf1P07141 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Csf1P07141 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Csf1P07141 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csf1P07141 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csf1P07141 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csf1P07141 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csf1P07141 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csf1P07141 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csf1P07141 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csf1P07141 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csf1P07141 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csf1P07141 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csf1P07141 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csf1P07141 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csf1P07141 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csf1P07141 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csf1P07141 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csf1P07141 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csf1P07141 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csf1P07141 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csf1P07141 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csf1P07141 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csf1P07141 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csf1P07141 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csf1P07141 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csf1P07141 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csf1P07141 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csf1P07141 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csf1P07141 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csf1P07141 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csf1P07141 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csf1P07141 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Csf1P07141 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csf1P07141 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csf1P07141 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csf1P07141 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csf1P07141 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csf1P07141 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csf1P07141 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csf1P07141 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csf1P07141 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Csf1P07141 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csf1P07141 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csf1P07141 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Csf1P07141 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csf1P07141 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csf1P07141 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csf1P07141 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csf1P07141 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csf1P07141 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csf1P07141 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csf1P07141 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csf1P07141 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csf1P07141 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Csf1P07141 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csf1P07141 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csf1P07141 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csf1P07141 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csf1P07141 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csf1P07141 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Csf1P07141 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Csf1P07141 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csf1P07141 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csf1P07141 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csf1P07141 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csf1P07141 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms