Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB2P05107 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB2P05107 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB2P05107 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB2P05107 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB2P05107 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB2P05107 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB2P05107 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB2P05107 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGB2P05107 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGB2P05107 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGB2P05107 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ITGB2P05107 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGB2P05107 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGB2P05107 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGB2P05107 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGB2P05107 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGB2P05107 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB2P05107 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB2P05107 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB2P05107 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB2P05107 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB2P05107 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB2P05107 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB2P05107 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB2P05107 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB2P05107 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB2P05107 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB2P05107 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB2P05107 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB2P05107 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB2P05107 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB2P05107 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB2P05107 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB2P05107 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGB2P05107 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGB2P05107 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGB2P05107 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB2P05107 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB2P05107 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGB2P05107 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGB2P05107 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGB2P05107 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGB2P05107 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB2P05107 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB2P05107 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB2P05107 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB2P05107 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB2P05107 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB2P05107 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB2P05107 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB2P05107 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB2P05107 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB2P05107 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB2P05107 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB2P05107 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB2P05107 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB2P05107 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB2P05107 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB2P05107 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB2P05107 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB2P05107 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGB2P05107 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGB2P05107 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGB2P05107 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB2P05107 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB2P05107 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB2P05107 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB2P05107 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB2P05107 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB2P05107 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB2P05107 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB2P05107 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB2P05107 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ITGB2P05107 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGB2P05107 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGB2P05107 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGB2P05107 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB2P05107 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB2P05107 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB2P05107 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB2P05107 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB2P05107 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGB2P05107 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGB2P05107 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGB2P05107 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGB2P05107 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGB2P05107 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGB2P05107 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB2P05107 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB2P05107 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB2P05107 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB2P05107 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB2P05107 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB2P05107 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGB2P05107 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGB2P05107 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGB2P05107 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGB2P05107 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGB2P05107 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms