Protein–RNA interactions for Protein: P04921

GYPC, Glycophorin-C, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYPCP04921 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GYPCP04921 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GYPCP04921 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GYPCP04921 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
GYPCP04921 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GYPCP04921 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GYPCP04921 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GYPCP04921 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GYPCP04921 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GYPCP04921 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GYPCP04921 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GYPCP04921 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GYPCP04921 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GYPCP04921 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GYPCP04921 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GYPCP04921 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GYPCP04921 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GYPCP04921 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
GYPCP04921 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GYPCP04921 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GYPCP04921 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GYPCP04921 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GYPCP04921 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GYPCP04921 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GYPCP04921 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GYPCP04921 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GYPCP04921 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GYPCP04921 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GYPCP04921 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GYPCP04921 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
GYPCP04921 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GYPCP04921 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
GYPCP04921 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GYPCP04921 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GYPCP04921 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GYPCP04921 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GYPCP04921 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GYPCP04921 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GYPCP04921 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GYPCP04921 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GYPCP04921 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GYPCP04921 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GYPCP04921 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GYPCP04921 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GYPCP04921 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GYPCP04921 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GYPCP04921 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GYPCP04921 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
GYPCP04921 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GYPCP04921 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GYPCP04921 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GYPCP04921 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GYPCP04921 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GYPCP04921 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GYPCP04921 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GYPCP04921 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GYPCP04921 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GYPCP04921 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GYPCP04921 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GYPCP04921 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GYPCP04921 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GYPCP04921 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GYPCP04921 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GYPCP04921 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GYPCP04921 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GYPCP04921 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GYPCP04921 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GYPCP04921 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GYPCP04921 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GYPCP04921 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GYPCP04921 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GYPCP04921 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GYPCP04921 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GYPCP04921 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
GYPCP04921 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GYPCP04921 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GYPCP04921 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GYPCP04921 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GYPCP04921 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GYPCP04921 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GYPCP04921 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GYPCP04921 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GYPCP04921 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GYPCP04921 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GYPCP04921 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GYPCP04921 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GYPCP04921 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GYPCP04921 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GYPCP04921 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GYPCP04921 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GYPCP04921 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GYPCP04921 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GYPCP04921 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GYPCP04921 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GYPCP04921 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GYPCP04921 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GYPCP04921 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GYPCP04921 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GYPCP04921 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GYPCP04921 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms