Protein–RNA interactions for Protein: P04440

HLA-DPB1, HLA class II histocompatibility antigen, DP beta 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPB1P04440 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-DPB1P04440 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-DPB1P04440 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-DPB1P04440 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-DPB1P04440 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DPB1P04440 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DPB1P04440 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DPB1P04440 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DPB1P04440 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DPB1P04440 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DPB1P04440 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DPB1P04440 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DPB1P04440 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DPB1P04440 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DPB1P04440 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DPB1P04440 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DPB1P04440 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DPB1P04440 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DPB1P04440 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DPB1P04440 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DPB1P04440 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DPB1P04440 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DPB1P04440 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DPB1P04440 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DPB1P04440 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DPB1P04440 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DPB1P04440 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DPB1P04440 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DPB1P04440 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DPB1P04440 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DPB1P04440 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DPB1P04440 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DPB1P04440 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DPB1P04440 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DPB1P04440 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DPB1P04440 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DPB1P04440 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DPB1P04440 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DPB1P04440 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DPB1P04440 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DPB1P04440 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DPB1P04440 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DPB1P04440 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DPB1P04440 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DPB1P04440 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DPB1P04440 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DPB1P04440 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HLA-DPB1P04440 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DPB1P04440 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DPB1P04440 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DPB1P04440 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DPB1P04440 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DPB1P04440 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DPB1P04440 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DPB1P04440 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DPB1P04440 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DPB1P04440 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DPB1P04440 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DPB1P04440 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DPB1P04440 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DPB1P04440 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DPB1P04440 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DPB1P04440 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DPB1P04440 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-DPB1P04440 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-DPB1P04440 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-DPB1P04440 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-DPB1P04440 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-DPB1P04440 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-DPB1P04440 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DPB1P04440 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DPB1P04440 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DPB1P04440 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DPB1P04440 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HLA-DPB1P04440 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-DPB1P04440 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-DPB1P04440 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-DPB1P04440 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-DPB1P04440 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DPB1P04440 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DPB1P04440 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DPB1P04440 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DPB1P04440 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DPB1P04440 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DPB1P04440 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DPB1P04440 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DPB1P04440 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DPB1P04440 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DPB1P04440 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DPB1P04440 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-DPB1P04440 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-DPB1P04440 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-DPB1P04440 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-DPB1P04440 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-DPB1P04440 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-DPB1P04440 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-DPB1P04440 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-DPB1P04440 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-DPB1P04440 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-DPB1P04440 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms