Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PRB1P04280 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRB1P04280 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRB1P04280 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRB1P04280 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRB1P04280 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRB1P04280 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRB1P04280 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRB1P04280 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRB1P04280 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRB1P04280 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRB1P04280 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRB1P04280 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRB1P04280 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PRB1P04280 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRB1P04280 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRB1P04280 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRB1P04280 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRB1P04280 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRB1P04280 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRB1P04280 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRB1P04280 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRB1P04280 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PRB1P04280 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRB1P04280 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRB1P04280 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRB1P04280 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRB1P04280 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRB1P04280 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRB1P04280 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRB1P04280 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRB1P04280 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRB1P04280 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRB1P04280 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRB1P04280 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRB1P04280 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRB1P04280 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRB1P04280 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRB1P04280 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRB1P04280 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRB1P04280 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRB1P04280 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRB1P04280 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRB1P04280 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRB1P04280 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRB1P04280 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRB1P04280 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRB1P04280 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRB1P04280 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRB1P04280 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRB1P04280 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRB1P04280 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRB1P04280 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRB1P04280 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRB1P04280 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRB1P04280 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRB1P04280 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRB1P04280 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRB1P04280 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRB1P04280 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRB1P04280 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PRB1P04280 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRB1P04280 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PRB1P04280 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PRB1P04280 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRB1P04280 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRB1P04280 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRB1P04280 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRB1P04280 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRB1P04280 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRB1P04280 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRB1P04280 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRB1P04280 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRB1P04280 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRB1P04280 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRB1P04280 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRB1P04280 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRB1P04280 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRB1P04280 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRB1P04280 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRB1P04280 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRB1P04280 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRB1P04280 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRB1P04280 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRB1P04280 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRB1P04280 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRB1P04280 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRB1P04280 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PRB1P04280 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRB1P04280 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRB1P04280 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRB1P04280 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRB1P04280 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRB1P04280 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRB1P04280 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRB1P04280 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PRB1P04280 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRB1P04280 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRB1P04280 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRB1P04280 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms