Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Hoxa7P02830 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hoxa7P02830 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Hoxa7P02830 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Hoxa7P02830 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hoxa7P02830 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Hoxa7P02830 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Hoxa7P02830 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Hoxa7P02830 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Hoxa7P02830 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Hoxa7P02830 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Hoxa7P02830 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Hoxa7P02830 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Hoxa7P02830 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Hoxa7P02830 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Hoxa7P02830 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hoxa7P02830 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hoxa7P02830 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hoxa7P02830 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hoxa7P02830 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hoxa7P02830 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Hoxa7P02830 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Hoxa7P02830 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Hoxa7P02830 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Hoxa7P02830 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Hoxa7P02830 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Hoxa7P02830 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Hoxa7P02830 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Hoxa7P02830 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Hoxa7P02830 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Hoxa7P02830 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Hoxa7P02830 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Hoxa7P02830 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Hoxa7P02830 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Hoxa7P02830 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Hoxa7P02830 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Hoxa7P02830 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Hoxa7P02830 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Hoxa7P02830 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Hoxa7P02830 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Hoxa7P02830 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Hoxa7P02830 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Hoxa7P02830 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Hoxa7P02830 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Hoxa7P02830 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Hoxa7P02830 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Hoxa7P02830 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Hoxa7P02830 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Hoxa7P02830 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Hoxa7P02830 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Hoxa7P02830 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Hoxa7P02830 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Hoxa7P02830 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hoxa7P02830 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hoxa7P02830 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hoxa7P02830 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Hoxa7P02830 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Hoxa7P02830 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Hoxa7P02830 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Hoxa7P02830 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Hoxa7P02830 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Hoxa7P02830 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Hoxa7P02830 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Hoxa7P02830 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Hoxa7P02830 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Hoxa7P02830 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Hoxa7P02830 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Hoxa7P02830 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Hoxa7P02830 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hoxa7P02830 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hoxa7P02830 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Hoxa7P02830 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Hoxa7P02830 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Hoxa7P02830 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Hoxa7P02830 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Hoxa7P02830 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Hoxa7P02830 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Hoxa7P02830 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Hoxa7P02830 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Hoxa7P02830 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Hoxa7P02830 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Hoxa7P02830 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Hoxa7P02830 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Hoxa7P02830 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Hoxa7P02830 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Hoxa7P02830 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Hoxa7P02830 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Hoxa7P02830 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Hoxa7P02830 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Hoxa7P02830 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Hoxa7P02830 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Hoxa7P02830 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Hoxa7P02830 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hoxa7P02830 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Hoxa7P02830 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hoxa7P02830 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hoxa7P02830 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Hoxa7P02830 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Hoxa7P02830 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Hoxa7P02830 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms