Protein–RNA interactions for Protein: P02730

SLC4A1, Band 3 anion transport protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A1P02730 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC4A1P02730 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC4A1P02730 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC4A1P02730 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC4A1P02730 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC4A1P02730 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC4A1P02730 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC4A1P02730 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC4A1P02730 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC4A1P02730 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC4A1P02730 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC4A1P02730 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC4A1P02730 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC4A1P02730 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC4A1P02730 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC4A1P02730 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC4A1P02730 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC4A1P02730 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A1P02730 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A1P02730 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A1P02730 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A1P02730 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A1P02730 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC4A1P02730 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC4A1P02730 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC4A1P02730 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SLC4A1P02730 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SLC4A1P02730 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC4A1P02730 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC4A1P02730 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC4A1P02730 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC4A1P02730 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC4A1P02730 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC4A1P02730 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC4A1P02730 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A1P02730 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A1P02730 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A1P02730 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A1P02730 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A1P02730 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A1P02730 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A1P02730 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A1P02730 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A1P02730 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A1P02730 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC4A1P02730 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC4A1P02730 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A1P02730 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A1P02730 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A1P02730 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A1P02730 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A1P02730 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A1P02730 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A1P02730 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A1P02730 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A1P02730 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A1P02730 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A1P02730 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A1P02730 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A1P02730 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A1P02730 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC4A1P02730 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC4A1P02730 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC4A1P02730 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC4A1P02730 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC4A1P02730 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC4A1P02730 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC4A1P02730 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC4A1P02730 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC4A1P02730 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC4A1P02730 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC4A1P02730 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A1P02730 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A1P02730 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A1P02730 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A1P02730 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A1P02730 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A1P02730 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A1P02730 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A1P02730 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A1P02730 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A1P02730 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A1P02730 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC4A1P02730 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC4A1P02730 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC4A1P02730 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC4A1P02730 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC4A1P02730 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC4A1P02730 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC4A1P02730 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC4A1P02730 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC4A1P02730 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC4A1P02730 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC4A1P02730 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A1P02730 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A1P02730 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A1P02730 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A1P02730 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A1P02730 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A1P02730 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms